クラウド型電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや活用例として、CDD社の「CDD Vault」の特長や事例を紹介 株式会社技術情報協会から2023年12月27日に『実験の自動化・自律化によるR&Dの効率化と運用方法 －AI、ロボット技術、ChatGPT、MI、ベイズ最適化、秘密計算など－』が発刊されました。 本書では、ラボラトリーオートメーションに関する技術や環境・体制構築のポイント、応用事例などが多数紹介されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第3章「自動・自律実験の運用における組織体制と社内展開の仕方」の第8節「クラウド型電子実験ノートを活用した研究データの統合的管理」にて、クラウド型電子実験ノートによる研究データの統合的管理のメリットの説明と、その具体例としてCDD Vaultの機能と利用事例の紹介を行っています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！ 「PDFダウンロード」からはCDD Vaultのカタログをダウンロードできます。

健康増進のための必須ツール 『ジェノプラン』は、ご自身で唾液を採取することで、 簡単に遺伝子検査を行える遺伝子検査キットです。 業界最速クラスの10営業日で検査結果の閲覧が可能。 生活習慣改善に対する食生活・運動習慣・スキンケアなどを最適化できます。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【遺伝子検査手順】 1.唾液抽出&ウェブ登録 2.唾液配送 3.DNA抽出&分析 4.結果レポート閲覧 5.自身の遺伝子的特徴・リスクポテンシャルの把握 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

"AlphaFold 2" と "I-TASSER" の両方を搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア「NovaFold AI」 【世界最高峰のアルゴリズムを搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア】 DNASTAR社は、タンパク質構造予測のリーディングソフトウェアである NovaFold に、Google傘下のDeepMind社によって開発され ”AlphaFold 2” のAIシステムを組み込んだ新しいバージョンをリリースしました。”AlphaFold 2” を搭載した「NovaFold AI」を使用することにより、ユーザーは Protean 3D の既存の NovaCloud サービスのインターフェイス内で ”AlphaFold 2” のタンパク質構造予測手法をシームレスに利用して、アミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、その結果を視覚化して分析できます。

低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。

logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います！ 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム 『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。 【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分けできる使用モード ■低分子・フラグメント・標的タンパク質データベース ■新機能開発やカスタマイズ ■サードパーティ製品との連携 ■Windows/Mac/Linuxに対応 ■計算化学者、実験研究者が広く利用 ■医薬、農薬、食品、材料設計などの様々な分野に対応 【搭載アプリケーション】 ■分子モデリング ■配座解析・分子動力学計算・量子化学計算 ■ドッキングシミュレーション ■構造活性相関・ケモインフォマティクス ■タンパク質・抗体モデリング ■変異体構築・タンパク質/ペプチドデザイン ■核酸モデリング ■ファーマコフォア解析 ■フラグメント構造に基づく分子設計

DNA 配列のアセンブリとアラインメント CodonCode Aligner は、DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、突然変異の検出に役立つプログラムです。Aligner は、親しみやすく、分かり易いユーザーインターフェースを備えていながら、Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフルサポートする能力を備えています。

GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレーション！同じプラットフォームのデータを横断的に発現解析 『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、（酵母、大腸菌） 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能 MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

ChemOffice/ChemDraw シリーズは、化学者と生物学者の研究活動を支援するサイエンスソフトウェアです。 ChemOffice/ChemDraw シリーズはパワフルな描画機能を備え、複雑な分子を可視化します。生体分子も簡単に表現できます。

信頼性の高いhERG阻害予測ツールで、心毒性リスクを創薬の早期に排除します！ 創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

イオン化され得るグループのpKaを計算！蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa（酸塩基解離定数）等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa：高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies：特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point：等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です！ 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

ラボのデータ、機器、およびワークフロー全てを管理するLIMSソフトウエア LIMS、すなわちラボラトリー情報管理システム（Laboratory Information Management System）は、サンプル、実験結果、ワークフローや分析機器に関連するデータを自動で収集し、分析するシステムです。 ラボにおける全てのデータを自動で収集することで、ラボの生産性や効率を向上させ、手入力によるミスや改ざんの防止によりコンプライアンスを強化し、企業のデータインテグリティを促進します。 Thermo Scientific SampleManager LIMS ソフトウエア は、LIMSだけでなく、電子ラボノート（ELN）、ラボ実行システム（LES）、科学データ管理システム（SDMS）の全てを兼ね備えたオールインワンソリューションです。 製薬・化学・金属・石油・食品など、さまざまな業界の生産における品質管理部門、そして研究開発（R&D）分野など、幅広い業界のラボでお使いいただいています。

ゲノムアセンブル、Phasing、Scaffolding、遺伝子予測やアノテーションを含めたデータセットで、実験を強力に支援！ PacBioが出力するロングリード配列を利用して、Assembleパイプラインを実行することにより、染色体に近づくような高品質なContig配列が得られます。 さらに、Phasing（アレルごとのContigが分離されて出力される）やScaffoldingも実現できるようになっています。 ・最新の技術を使用して、ゲノム配列のassemblyや遺伝子予測、機能注釈を含めたリファレンスデータの作成を行います。 ・生物種により、必ずしも同じ手順で、期待通りの結果をなるとは限らず、データ解析の各段階で評価を行いながら手法を検討して進めます。 ・出力結果を検索参照できるWebシステムも提供します。

核酸配列やアミノ酸配列にリッチな注釈を付与し、遺伝子の機能解釈を補助します。 （１）NCBI-nrへのBLASTによるアノテーションの付与 （２）OrthologDBであるEggNOGによるアノテーション （３）Interproによるアノテーション （５）RNA-seq リード の利用