製品ランキング バイオインフォマティクス
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logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います! 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能! 『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの標準アプリケーションと組み合わせて、生物学的製剤の開発における 問題や課題をクリアにし、in-silicoを用いた合理的な分子設計が可能です。 【特長】 ■バイオ医薬品開発のためのカスタムアプリケーション ■従来のMOEのメニューにBio-MOEメニューを新規に追加し使用 ■より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行える ■生物学的製剤の開発における問題や課題をクリア ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載 「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析(疎水性/電荷) ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です! 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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配列解析に最適化されたスプレッドシートを提供!バイオポリマーを取り扱うことが出来ます 『SARvision Biologics』は、既存のバイオロジックスソフトウエアの 隙間を埋めるデスクトップアプリケーションです。 バイオポリマーのデータを読み込み整理する為の基盤ツールと配列と活性の 関連を見出す様々なツールを提供。 配列解析に最適化されたスプレッドシートが提供され、非天然アミノ酸や 化学的に修飾された残基を含む、核酸、タンパク、ペプチドといった バイオポリマーを取り扱うことが出来ます。 【特長】 ■ペプチド、抗体、RNAに関する研究をを支援 ■非天然アミノ酸、環化、化学修飾を含むペプチドの取り扱いが可能 ■ヒートマップによる活性の視覚化機能 ■興味のある領域のハイライト ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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イオン化され得るグループのpKaを計算!蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa(酸塩基解離定数)等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa:高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies:特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point:等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用意! パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin:パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin:コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin:分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール 『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することができ、Scaffold Hopping へ の適用(新規母核構造の発見)も可能です。 【特長】 ■典型的な化合物カタログに対する検索が標準的なPCを使って15秒程度で終了します ■フィンガープリントベースで類似度が低いと判断された化合物を、 FTrees記述子を用いたファジー検索では高い類似度でヒットします ■重ね合わされた構造から、共通の官能基(または異なる官能基)を明らかにします ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします 「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸(特殊アミノ酸)の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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多様なバイオモダリティー情報の登録・管理をHELMネイティブのソリューションで解決 『PatRegi|Bio』は、特殊ペプチド、核酸、抗体、ADC、PDC、ナノ粒子コンジュゲートなど非天然または化学的に修飾された残基や化学的装飾を含む多様な生物学的モダリティーをサポートする、バイオ分子の登録・管理のアプリケーションです。 HELMネイティブのプラットフォームをベースに、モノマーの一元管理を行うことで長期にわたる相互運用性を確保し、組織内外とのデータ交換もスムーズに行えます。 【特長】 ■ウェブベースのアプリケーションで、オンプレミス又はクラウドに設置し共同研究をサポート可能 ■お客様個別のニーズに対応した、きめ細かなカスタマイズが可能 ■コーポレートのモノマーデータベースと連動した、直感的なバイオ分子エディタ「BioEddie」で複雑な分子も素早く、正確に描画 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけ!候補を提案します 『AMEDEO』は、データサイエンス(AIと機械学習)で利用可能な高度なツールを専門家以外が簡単に利用し、リード最適化サイクルを高速化するためのアイデアジェネレーターとして機能します。 データについて学習し、予測的なモデルを構築および選択。 次に作成すべき化合物を明確に提案します。 最適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけで、 バイオ医薬または低分子医薬の候補を提案します。 【特長】 ■リード最適化サイクルを高速化するためのアイデアジェネレーター ■データについて学習し、予測的なモデルを構築および選択 ■次に作成すべき化合物を明確に提案 ■最適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけ ■バイオ医薬または低分子医薬の候補を提案 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価!プロパティー計算プラグイン 『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。 実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。 当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれており、計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでご契約いただけます。 【特長】 ■高いパフォーマンスと多様な活用法を実現 ■薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価 ■強力なリード生成・リード最適化ツール ■“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれている ■計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでできる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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信頼性の高いhERG阻害予測ツールで、心毒性リスクを創薬の早期に排除します! 創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します! NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に 重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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Marvinライセンスで利用可能!分子の元素構成に関する値を計算・表示します パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass:molecular mass ■Exact mass:molecular mass calculated from the most frequent natural isotopes of the elements ■Formula:chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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ラボのデータ、機器、およびワークフロー全てを管理するLIMSソフトウエア LIMS、すなわちラボラトリー情報管理システム(Laboratory Information Management System)は、サンプル、実験結果、ワークフローや分析機器に関連するデータを自動で収集し、分析するシステムです。 ラボにおける全てのデータを自動で収集することで、ラボの生産性や効率を向上させ、手入力によるミスや改ざんの防止によりコンプライアンスを強化し、企業のデータインテグリティを促進します。 Thermo Scientific SampleManager LIMS ソフトウエア は、LIMSだけでなく、電子ラボノート(ELN)、ラボ実行システム(LES)、科学データ管理システム(SDMS)の全てを兼ね備えたオールインワンソリューションです。 製薬・化学・金属・石油・食品など、さまざまな業界の生産における品質管理部門、そして研究開発(R&D)分野など、幅広い業界のラボでお使いいただいています。