製品ランキング バイオインフォマティクス
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低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います! 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析 MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、 分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。 分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質-リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を支援します。 【Solvent Analysis の特長】 ■3D-RISM 法に基づいて1 分子系あたり数分で計算 ■複合体、リガンド、受容体の各分子系を同時に処理 ■計算には水分子の相関を考慮 ■水分子だけでなく、イオンや疎水性原子の存在確率も可視化 ■長時間のシミュレーションが不要 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載 「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析(疎水性/電荷) ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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雑誌掲載記事の別刷進呈! 電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや、分析化学分野での活用法などを紹介 実験においては、参考文献、標準手順書、使用する試薬や機材の情報、行った作業内容やその際の観察結果、分析機器からの出力など、多種多様な情報を扱います。 電子実験ノート(ELN)は、これらの情報を適切に管理し、有効活用するためのシステムです。 CDD Vault ELNは創薬研究をはじめ様々な分野の実験を柔軟に記録することができるクラウド型ELNで、サンプル・アッセイ情報管理システムCDD Vaultのオプションモジュールです。 CDD Vaultは企業・大学・公的研究機関などでの多数の導入実績のほか、複数の組織による共同研究プロジェクトの情報共有プラットフォームとしての採用事例もあります。 現在、ELNのメリットや『CDD Vault ELN』の特長が紹介された記事 『クラウド型電子実験ノートによる研究データの統合的管理 ―CDD Vault ELNの紹介―』 の別刷資料を進呈中です。 「お問い合わせ」より「別刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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ソフトの画面 (GUI) 操作のみでの簡単 NGS 解析・RNA-seq、変異解析、微生物叢解析などの解析を1ツールで可能 QIAGEN CLC Genomics Workbench (CLC GWB) は、GUI (グラフィカルユーザーインターフェイス) 操作のみでNGS データ2次解析を可能にします。フリーツールを用いた解析の場合、複雑な解析ワークフローの構築にバイオインフォマティクスの専門知識を必要とすることが多く、また多様な解析目的に対応していません。CLC GWB は、多様な目的での NGS データ解析を可能にするツールで、コマンドラインの使用やコーディングも必要ありません。CLC GWB を用いれば、RNA-seq、変異解析、微生物関連解析といった多様な解析を同様の GUI 操作で行えるため新し解析法の習得が容易です。ユーザーは自由に解析に用いるリファレンス配列を変更でき、ワークフローを構成する各ツールの互換性に悩まされることもありません。これらの特徴は、CLC GWB が医学生物学研究のみならず、バイオ医薬品の品質管理にも 使用される理由になります。 【特徴】 ■GUI 操作での多様な NGS 2次解析 ■多様な目的での NGS 2次解析 ■有償・無償のプラグイン高拡張性 ■ウエット研究者使用可能メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール 『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することができ、Scaffold Hopping へ の適用(新規母核構造の発見)も可能です。 【特長】 ■典型的な化合物カタログに対する検索が標準的なPCを使って15秒程度で終了します ■フィンガープリントベースで類似度が低いと判断された化合物を、 FTrees記述子を用いたファジー検索では高い類似度でヒットします ■重ね合わされた構造から、共通の官能基(または異なる官能基)を明らかにします ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現! 『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit(誘導適合)にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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ペプチドの解析、改変、構築を支援する多彩な機能で研究をサポートします 「MOE」はペプチド解析のための機能を多数搭載しております。 変異体解析として自動的な変異体モデルの構築と、各種物性値の推算などが可能です。 相互作用解析では、ドッキング計算によるペプチド-受容体複合体の構造 予測などが行えます。表面解析機能により分子表面の特徴づけも行えます。 配列を指定しペプチドを構築することも可能です。ペプチドの解析、 改変、構築を行える多彩な機能により研究をサポートします。 【特長】 ■ペプチド構築 ■変異体解析 ■相互作用解析 ■表面解析 ■構造解析 ■非天然アミノ酸(特殊アミノ酸)の構築/変異もサポート ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載 「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加 されました。Matched MolecularPair(MMP)解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。 「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 【MOEsaic 機能】 ■リガンド解析とSAR解析のためのWebアプリケーション ■部分構造と類似構造検索 ■R-group解析とプロファイリング ■Matched Molecular Pair解析(MMPs) ■新規バーチャルリガンドデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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ビッグデータに隠された情報と相互関係の発見、解明に威力を発揮し、あらゆる分野の問題を迅速に解決しています。 多変量統計解析、スペクトル解析、実験計画と最適化、知覚・官能データの解析、PATなどをテーマにトレーニングコースを開催しております。 産業界、研究界で希求される多変量統計解析の運用能力。本コースでは、複雑なデータの関係性の速やかな解釈、最新の多変量統計解析技術の業務応用能力を獲得できます。数学的な説明は最小限に抑え、実践的な内容です。本コースを修了されると、多変量統計解析を使った製品・プロセスの最適化、差異分析・分類、予測定量をスムーズに業務応用できます。 集合研修、インハウスセミナーを実施しています。 集合研修: 2日間トレーニングセミナー 多変量統計解析を用いた理論と実例 産業界、研究界で希求される多変量統計解析の運用能力。本コースでは、複雑なデータの関係性の速やかな解釈、最新の多変量統計解析技術の業務応用能力を獲得できます。数学的な説明は最小限に抑え、実践的な内容です。本コースを修了されると、多変量統計解析を使った製品・プロセスの最適化、差異分析・分類、予測定量をスムーズに業務応用できます。メーカー・取扱い企業: 株式会社クオリテイデザイン
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統合計算化学システムMOE-QFSSの新バージョンについてご紹介! 当資料では、QFSSの概要と新機能、構造検索事例について掲載しています。 「MOE-QFSS」は、複数の巨大な化合物データベースに対して高速かつ 横断的に構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 新バージョンでは、公共データベースへのアクセスと MOE/web SOAPサーバーでの検索に対応しました。 さらに、QFSSのMOE/webアプリケーションを提供。それによって目的や 計算資源に応じたQFSSの実行環境を構築できます。 【掲載内容】 ■QFSS概要 ■QFSSによる検索 ■バージョンアップ内容 ■QFSSを用いた応用事例 ■QFSSの入手方法 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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DNA-seqやSNVおよびIndelの検出など!Flowを用いたデータ解析についてご紹介! 当資料では、次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェア「Flow」を用いた DNA-seqデータ解析について紹介します。 「Partek Flow(Flow)」は、次世代シーケンサー(NGS)から出力された リード配列を読み込んで、RNA-seqやDNA-seqのデータを解析することが可能です。 検出した変異のアノテーションや絞り込みや染色体ビューアーでの変異の表示など、 データ解析を行うための豊富な機能を搭載しています。 【掲載内容】 ■DNA-seqとは ■SNVおよびIndelの検出 ■融合遺伝子の検出 ■コピー数変異の検出 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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正確で確実なデータを簡単に入力でき、データ確認時間の短縮にも貢献! BIOVIA Captureは、実験実施計画書を簡単且つ正確に入力でき、データの確認時間も短縮できるため、多くの製薬企業で使用されています。メーカー・取扱い企業: ダッソー・システムズ株式会社
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イオン化され得るグループのpKaを計算!蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa(酸塩基解離定数)等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa:高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies:特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point:等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成!ヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須 パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin:立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin:互変異性体の計算 ■Resonance:共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します! NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に 重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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Marvinライセンスで利用可能!分子の元素構成に関する値を計算・表示します パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass:molecular mass ■Exact mass:molecular mass calculated from the most frequent natural isotopes of the elements ■Formula:chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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ラボのデータ、機器、およびワークフロー全てを管理するLIMSソフトウエア LIMS、すなわちラボラトリー情報管理システム(Laboratory Information Management System)は、サンプル、実験結果、ワークフローや分析機器に関連するデータを自動で収集し、分析するシステムです。 ラボにおける全てのデータを自動で収集することで、ラボの生産性や効率を向上させ、手入力によるミスや改ざんの防止によりコンプライアンスを強化し、企業のデータインテグリティを促進します。 Thermo Scientific SampleManager LIMS ソフトウエア は、LIMSだけでなく、電子ラボノート(ELN)、ラボ実行システム(LES)、科学データ管理システム(SDMS)の全てを兼ね備えたオールインワンソリューションです。 製薬・化学・金属・石油・食品など、さまざまな業界の生産における品質管理部門、そして研究開発(R&D)分野など、幅広い業界のラボでお使いいただいています。
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健康増進のための必須ツール 『ジェノプラン』は、ご自身で唾液を採取することで、 簡単に遺伝子検査を行える遺伝子検査キットです。 業界最速クラスの10営業日で検査結果の閲覧が可能。 生活習慣改善に対する食生活・運動習慣・スキンケアなどを最適化できます。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【遺伝子検査手順】 1.唾液抽出&ウェブ登録 2.唾液配送 3.DNA抽出&分析 4.結果レポート閲覧 5.自身の遺伝子的特徴・リスクポテンシャルの把握 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。メーカー・取扱い企業: ジェノプランジャパン株式会社
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【使用開始にあたり特別な準備やトレーニングが不要!】シンプルな画面構成で直観的に操作ができる電子実験ノートのご紹介 電子実験ノート 『 BIOVIA Notebook 』は簡単に導入・運用できるELN/電子実験ノートで、研究開発部門のDX化推進に好適なツールです。 実験業務において、研究開発のスピードUP、コスト削減、 組織間情報共有を実現することで研究開発でのイノベーションを促進します。 過去には数億円規模でのコストダウンや4,000ユーザの運用でも専任不要の実績がございます。 また BIOVIA Notebook付随の「Pipeline Pilot」を使用することで データ分析,可視化もできますし、LIMS含め他のシステムとの連携対応も可能です。 【特長】 ■共通のフォーマットで記載内容が見やすくなる ■シンプルな画面構成で、直観的に操作可能 ■導入&スタートが簡単 ■使用開始するまでに特別な準備やトレーニングが不要 ■Word / Excel / PowerPointや、多数のWebブラウザー対応 ■電子実験ノート内の優れた検索システムでデータを無駄なく活用 ※詳しくはPDFダウンロードよりご確認ください。メーカー・取扱い企業: 株式会社ウェーブフロント 本社
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がんの実用的変異の特定で分子検査、医薬品開発、基礎研究の迅速化・適切なターゲットの特定で医薬品開発、コンパニオン診断を迅速化 Human Somatic Mutation Database (HSMD) は、臨床的に観察された体細胞変異の分子診断、医薬品開発等における有用性に関する多くの情報を収載しています。研究、分子診断、医薬品開発において潜在的に実用的な遺伝子変異を特定することは、重要で困難なステップです。HSMD を使用することで、変異の特性を簡単に検索し、医薬品ラベル、治験、専門的ガイドラインからの重要な情報に迅速にアクセスできます。医薬品開発や臨床的 NGS 検査の迅速化にご興味のある方は、是非、お問合せ下さい。 【特徴】 ■20年以上にわたる体細胞変異に関する情報収集 ■変異の臨床的意義・医薬品開発における有用性などの実用性の理解をサポート ■ウェブベースのアプリケーションで簡単アクセス ■545000件以上の症例由来の情報メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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ヒトがん体細胞変異の世界的データベース・臨床的に重要な変異の選別に活用・がん変異リポート作成に最適の情報収載 COSMIC (がんにおける体細胞変異カタログ) は、ヒトのがんにおける体細胞変異の影響を解析するための世界最大級かつ最も網羅的なリソースです。COSMIC は、6,800 種類を超えるヒトのがんにおける 2,400 万を超えるゲノム変異 (2024年10月現在) を収載し、変異科学者やバイオインフォマティクス研究者に、専門家がキュレーションした知識を提供します。このヒトがんの体細胞変異の世界最大級のデータベースは、ヒトがんの基礎研究、変異の評価に幅広く活用され、大多数のヒトがん変異の評価レポート作成サービスに利用されています。 【特徴】 ■臨床的に重要な変異の優先付け ■変異の actionability 情報付加 ■変異頻度の迅速評価 ■ゲノム座標の正確な情報 ■COSMIC IDでレポートに重要情報付加メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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全ゲノム、全エキソーム解析、解釈、レポーティングのトータルサポート・ヒト WGS/WES の変異評価の負担を軽減 臨床および集団ゲノミクスでは、全ゲノムシーケンス(WGS)および全エキソームシークエンス(WES)が主流になりつつあります。しかしながら、大量のデータ解析は、インフォマティクスの専門知識、解析速度、コスト面で大きな負担であり、大量に検出される変異の解釈はさらなる重荷になっています。 QIAGEN の高速 NGS データ2次解析ツール、QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium の LightSpped Module は、FPGA や GPU のような高価な専用ハードウェアを必要とせず、コスト面でも大きな利点があります。変異評価の世界的データベース、HGMD Professional(生殖細胞変異)、COSMIC(体細胞変異)、HSMD(体細胞変異)や、生殖細胞・体細胞変異の解釈を透明性を保って実施する QCI Interpret は、大量の変異評価の標準化、低コスト化、高速化をサポートします。全ゲノムシーケンス由来の大量の変異評価にお困りの方、是非、お問合せ下さい。 【特徴】 ■高速 NGS 2次解析 ■体細胞・生殖細胞変異の評価の透明化・高速化・標準化メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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DNA 配列のアセンブリとアラインメント CodonCode Aligner は、DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、突然変異の検出に役立つプログラムです。Aligner は、親しみやすく、分かり易いユーザーインターフェースを備えていながら、Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフルサポートする能力を備えています。メーカー・取扱い企業: 株式会社ヒューリンクス
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置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支援ツール 『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、ヒト化抗体の構築。抗原とのエピトープマッピングに対応。 統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域(CDR)を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化 カタログを刷新しました。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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GENEVESTIGATORを使ったプラットフォーム横断的な遺伝子発現解析によりデュピルマブの新規適応症の可能性を検討 Nebion社のPhilip Zimmermann、Jana Sponarova、Frank Staubliは、同社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、IL-4Rαに対するモノクローナル抗体で阻害剤として働くデュピルマブの発現パターンを解析しました。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 このケーススタディの概要は以下の通りです。 ■類似の発現応答をもたらす実験条件の特定 ■潜在的な新規適応症の特定 ■他の解剖学的部位における発現 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアライメントからパスウェイを使った生物学的解釈まで実行 Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS/マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています。これらのソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアラインメントからパスウェイを使った生物学的解釈まですべてサポートします。 Partek FlowはFASTQファイルを読み込んで、アラインメント前後のQA/QC、参照ゲノム配列へのアラインメント、発現量の定量および正規化、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析、主成分分析や階層型クラスタリング、GOやパスウェイを使った生物学的解釈、ゲノムビューアーによる可視化などRNA-seqのデータ解析全般をサポートします。 Partek Genomics SuiteはBAMファイルを読み込んで、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析に加えてアリル特異的発現解析、コーディング領域のSNV解析をサポートします。 Partek PathwayはKEGGパスウェイ情報を使ったパスウェイ解析をサポートします。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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トランスレーショナルサイエンスを支援する 全ての研究者のための強力なビッグデータプラットフォーム ライフサイエンス分野のBig Dataには文献、治験、化合物をはじめとする様々な公共データベースで公開されている情報が登録されています。これらの情報をもとに網羅的なマイニング検索を行うことはすべてのライフサイエンスの基礎研究にとって重要な作業です。BaseSpace Correlation Engineは、すべてのライフサイエンス分野の研究者に役立つ強力なデーターマイニングのツールです。また、BaseSpace Correlation Engineは、は膨大な量と種類の医療分野のオミックスデータから構成され、疾患原因究明、バイオマーカー開発などの目的ですでに広く利用されています。さらに組織・器官ごとの遺伝子発現の特異性を研究するために開発されたBody Atlasなど独自のデータベースに加え、異なる手法のオミックス実験データを直接比較できるTiling array解析などのツールを備えた強力な解析システムです。メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
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コホート・臨床ゲノム解析を支援する 臨床・創薬研究者のための最強ビッグデータプラットフォーム 医療分野のBig Dataは新医療技術創生の強力なテクノロジーとして期待されています。BaseSpace Cohort Analyzerは各種がん患者、自己免疫患者などの診療データ、治療の履歴と各種のオミックスデータを検索することができ、さらにさまざまな解析ツールによって患者の特性に応じた薬剤の効果を研究することのできる画期的なMedical Big Dataシステムです。また、Observational Studiesの情報は、最新の医療現場で早期診断やオーダーメイド医療への活用に利用されています。BaseSpace Cohort Analyzerは各種がん患者、自己免疫患者などの診療データ、治療の履歴と各種のオミックスデータを検索することができ、さらにさまざまな解析ツールによって疾患の原因となる遺伝子の変異や動態の詳細を解明し、治療のアドバイスを得られる画期的なシステムです。メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
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多様なバイオモダリティー情報の登録・管理をHELMネイティブのソリューションで解決 『PatRegi|Bio』は、特殊ペプチド、核酸、抗体、ADC、PDC、ナノ粒子コンジュゲートなど非天然または化学的に修飾された残基や化学的装飾を含む多様な生物学的モダリティーをサポートする、バイオ分子の登録・管理のアプリケーションです。 HELMネイティブのプラットフォームをベースに、モノマーの一元管理を行うことで長期にわたる相互運用性を確保し、組織内外とのデータ交換もスムーズに行えます。 【特長】 ■ウェブベースのアプリケーションで、オンプレミス又はクラウドに設置し共同研究をサポート可能 ■お客様個別のニーズに対応した、きめ細かなカスタマイズが可能 ■コーポレートのモノマーデータベースと連動した、直感的なバイオ分子エディタ「BioEddie」で複雑な分子も素早く、正確に描画 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけ!候補を提案します 『AMEDEO』は、データサイエンス(AIと機械学習)で利用可能な高度なツールを専門家以外が簡単に利用し、リード最適化サイクルを高速化するためのアイデアジェネレーターとして機能します。 データについて学習し、予測的なモデルを構築および選択。 次に作成すべき化合物を明確に提案します。 最適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけで、 バイオ医薬または低分子医薬の候補を提案します。 【特長】 ■リード最適化サイクルを高速化するためのアイデアジェネレーター ■データについて学習し、予測的なモデルを構築および選択 ■次に作成すべき化合物を明確に提案 ■最適化項目等の目標に関するいくつかの簡単な質問に答えるだけ ■バイオ医薬または低分子医薬の候補を提案 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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配列解析に最適化されたスプレッドシートを提供!バイオポリマーを取り扱うことが出来ます 『SARvision Biologics』は、既存のバイオロジックスソフトウエアの 隙間を埋めるデスクトップアプリケーションです。 バイオポリマーのデータを読み込み整理する為の基盤ツールと配列と活性の 関連を見出す様々なツールを提供。 配列解析に最適化されたスプレッドシートが提供され、非天然アミノ酸や 化学的に修飾された残基を含む、核酸、タンパク、ペプチドといった バイオポリマーを取り扱うことが出来ます。 【特長】 ■ペプチド、抗体、RNAに関する研究をを支援 ■非天然アミノ酸、環化、化学修飾を含むペプチドの取り扱いが可能 ■ヒートマップによる活性の視覚化機能 ■興味のある領域のハイライト ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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HELMでバイオ分子の完全なハンドリングを実現!明確な表現を可能にします 『Biomolecule Toolkit』は、ADCやペプチドといった複雑なバイオ分子の取扱いにおいて、化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しするHELMベースのウエブサービスベースのツールです。 的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能。 既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張したり、バイオ分子登録システムの基盤としてご利用になれ、お客様独自のワークフローやビジネスロジックに合わせて、バイオ分子の正規化、登録、検索機能などを利用できます。 【特長】 ■化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しする ■的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能 ■既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張 ■バイオ分子登録システムの基盤として利用可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価!プロパティー計算プラグイン 『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。 実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。 当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれており、計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでご契約いただけます。 【特長】 ■高いパフォーマンスと多様な活用法を実現 ■薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価 ■強力なリード生成・リード最適化ツール ■“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれている ■計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでできる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です! 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用意! パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin:パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin:コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin:分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
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"AlphaFold 2" と "I-TASSER" の両方を搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア「NovaFold AI」 【世界最高峰のアルゴリズムを搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア】 DNASTAR社は、タンパク質構造予測のリーディングソフトウェアである NovaFold に、Google傘下のDeepMind社によって開発され ”AlphaFold 2” のAIシステムを組み込んだ新しいバージョンをリリースしました。”AlphaFold 2” を搭載した「NovaFold AI」を使用することにより、ユーザーは Protean 3D の既存の NovaCloud サービスのインターフェイス内で ”AlphaFold 2” のタンパク質構造予測手法をシームレスに利用して、アミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、その結果を視覚化して分析できます。メーカー・取扱い企業: シップスバイオサイエンス株式会社
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バイオ医薬品向けハイスループット糖鎖特性評価ソフトウェア GlycanExplorerは、糖タンパク質バイオ医薬品の糖鎖の特性評価と定量化のためのワンストップソフトウェアソリューションです。プリロードされた高解像度の正確な糖鎖スペクトルデータベースを使用して、比類のない信頼性で可能性のある糖鎖構造を特定できます。インタラクティブなチャートとプロットを備えた広範囲で包括的なデータ構成により、糖鎖サンプルの詳細なプロファイリングが容易になり、意味のある生物学的結論を引き出すのにさらに役立ちます。メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
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全ての科学研究データベースを横断検索 ■単一の横断検索 ドットマティクス、社内リポジトリ、サードパーティ、それぞれのデータベースから横断検索ができる。必要な研究データを1か所で管理、共有し、ビッグデータの管理を効率化。進捗状況や優先順位に関する質問にすばやく回答できる。 ■詳細なレポート機能 科学者はプロジェクトレベルおよびユーザーレベルで、研究データの検索フォーム、ビュー、クエリ、リストを確認し、管理できる。 ■科学データの検索と参照 化学構造検索や類似性検索が実行できる科学データ検索機能と、フォーム、表、チャートを用いたデータ可視化機能でインサイトを強化。メーカー・取扱い企業: ドットマティクス株式会社
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包括的な履歴追跡と安全な研究データ管理 ■系統と一意性の追跡 実験を記録して保存し、直感的な単一のフレームワークで社内外の共同研究者と共有できる。安全な電子実験ノートでデータドリブンな意思決定をサポート。 ■一元化されたデータ管理 治療薬候補など非常に価値のある研究データを管理。知的財産を保護し、データの精度を向上させることができる。 ■幅広い生物由来物質に対応 DNA、RNA、ペプチド、タンパク質、抗体、コンジュゲート、非天然ペプチド、ヌクレオチド、プラスミド、細胞株、ユーザー定義のエンティティなど、幅広い生物由来物質に対応。メーカー・取扱い企業: ドットマティクス株式会社
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業界をリードする高品質なソリューションとの組み合わせが実現 ■複雑で幅広いデータに対応 スクリーニングデータ分析ソリューションであるScreening Ultraは、従来のHTSから時系列の生データまで幅広いスクリーニングデータの分析が可能です。 ■データの処理を完全に自動化 Insightful ScienceやBioBrightの統合で、業界をリードする高品質なソリューションとの組み合わせが実現しました。例えば、HTSのワークフローが完全に自動化され、手作業なしで、プレートリーダーの生データファイルをアップロードできます。 ■迅速で効率的なリード選択 Geneious Biologicsでは、ドットマティ クスのアプリケーションからデータを直接読み取ることができ、抗体配列をスクリーニング分析と組み合わせることもできます。メーカー・取扱い企業: ドットマティクス株式会社
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「こんなサイトがあったのか!」驚きと未知の、かつ確かな生物関係リンクへと導く発見ガイドブック! ◇読み物でも情報誌でもない、今までに無かった生物情報検索ガイド集! ◇求める情報により速くたどり着ける!QRコード216個掲載&リンクをPCに飛ばして即検索可能! ◇Special Web Site情報として「新型コロナウイルス(COVID-19)」関連Webサイトを掲載! ◇将来のキャリアパスを考える方のために!生物関連の各賞の歴代受賞者&テーマを一覧表で紹介! ◇一般の方が楽しめるWebサイトやアプリも紹介!メーカー・取扱い企業: 株式会社エヌ・ティー・エス
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遺伝子検査で体質を判定し、自身の遺伝子型に対応した的確な予防措置を取りましょう 『マイセルフ遺伝子検査』は、各種体質遺伝子(DNA)検査において、 潜在する体質確認のためのツールとしてご活用いただけます。 生活習慣病および各種がんリスク検査において、高齢化社会になり 発症のリスク患者が毎年増え続けております。 手軽にできて精度の高いスクリーニング検査としてご利用可能です。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【取扱製品】 ■各種体質遺伝子(DNA)検査キット ■子宮頸癌および性感染症(STD)検査キット ■生活習慣病および各種がんリスク検査キット ※詳しくはお気軽にお問い合わせください。メーカー・取扱い企業: 株式会社プロップジーン
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MI、第一原理計算の材料別ケースや各種手法の最新動向をリサーチした、新素材開発・創薬効率化、次世代ビジネスに向けた書籍です。 ■ 発 行:2024年1月12日 【本書の特徴】 ➢ Citrine InformaticsやEnthoughtなどのMI支援サービス企業と日本勢との開発動向! ➢ MIを活用した高分子材料、電池材料、金属・無機材料の特徴、ビジネス動向を掲載! ➢ 第一原理計算による、リチウムイオン電池や半導体材料などの材料別ケースを記載! ➢ スパースモデリングが注目される背景、大学研究、及び、導入している企業を紹介! ➢ MicrosoftやGoogle等のビッグテックや、AI搭載のソフトウエア企業の創薬事業とは? ➢ 量子コンピュータ、量子ソフトウエアとマテリアル開発との関係、材料開発を詳述! ➢ 素材産業における量子コンピューティングのユースケースの探求に関心が高まる!メーカー・取扱い企業: 株式会社シーエムシー・リサーチ
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独自技術のAIを駆使したアプローチで、化学業界、材料業界に革新を起こします 『Polymerize Labs』は、独自のデータ処理機能を搭載し、様々な形式の スプレッドシートデータを取り込むことができ、簡単に導入いただける プラットフォームです。 データの一元管理機能と独自のAIアルゴリズムによる予測機能を 搭載しています。開発目標達成のための、実験に関する提案や 分析・洞察を得ることができます。 【特長】 ■プロジェクト管理 ■過去の実験データの分析 ■データ管理 ■実験計画法 ■AIエンジンを駆使した結果予測 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。メーカー・取扱い企業: POLYMERIZE合同会社 ポリマライズ日本法人
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クラウド型電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや活用例として、CDD社の「CDD Vault」の特長や事例を紹介 株式会社技術情報協会から2023年12月27日に『実験の自動化・自律化によるR&Dの効率化と運用方法 -AI、ロボット技術、ChatGPT、MI、ベイズ最適化、秘密計算など-』が発刊されました。 本書では、ラボラトリーオートメーションに関する技術や環境・体制構築のポイント、応用事例などが多数紹介されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第3章「自動・自律実験の運用における組織体制と社内展開の仕方」の第8節「クラウド型電子実験ノートを活用した研究データの統合的管理」にて、クラウド型電子実験ノートによる研究データの統合的管理のメリットの説明と、その具体例としてCDD Vaultの機能と利用事例の紹介を行っています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい! 「PDFダウンロード」からはCDD Vaultのカタログをダウンロードできます。メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
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ヒト生殖細胞性変異評価負担軽減・ヒト遺伝性疾患の原因遺伝子変異の網羅的データベース・NHS England 等の有名機関で採用 Human Gene Mutation Database (HGMD) Professional は、ヒト遺伝性疾患の原因遺伝子変異を網羅的に収載するデータベースです。今日では、1日平均約110以上(2021~2023) の新規変異が報告されており、HGMD Professional の高い網羅性は、本データベースを貴重でユニークなリソースにしています。また、遺伝学の専門家が実際に論文を読んで収集する情報は、高品質です。 【特徴】 ■高い網羅性(論文発表された遺伝性疾患の原因遺伝子変異を網羅的に収載:2024年9月現在約51万の変異を収載) ■高品質(専門家が実際に論文を読んで収載する情報で著者のミスを修正して収載する場合があるほどの品質) ■最新性(通常年4回のアップデートがあり最新性を維持)メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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病理、薬理、発生分化などの分子機序仮説構築サポート・実験的検証可能な重要分子の予測・25年を超える人手による知識ベースの活用 QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) は、Transcriptome や Proteome 解析で得られるオミックスデータの生物学的解釈をサポートするウェブベースのソフトウェアです。25年を超える人手によるキュレーション(マニュアルキュレーション)知識ベースを活用した解析は、例えば遺伝子発現変動のようなタンパク質活性とはあまり関係のない情報から重要タンパク質の役割やその活性化状態の推測を行い、検証可能な分子機序仮説の構築をサポートします。また、公共レポジトリ由来の膨大なオミックスデータを IPA で事前解析した結果の活用は、自身の IPA 解析の結果と予想もしない IPA 事前解析の結果との類似性を自動で評価し、新規の仮説構築をサポートします。 【特徴】 高品質なマニュアルキュレーション知識ベースの活用 仮説構築に公共レポジトリ由来の膨大なオミックスデータの簡単活用が可能 知識ベースの辞書的活用 ウェブベースのツールで IT 等の専門知識は不要 有償の解釈ツールでの最大の引用数(2024年9月現在)メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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ソフトの画面 (GUI) 操作のみでの簡単 NGS 解析・RNA-seq、変異解析、微生物叢解析などの解析を1ツールで可能 QIAGEN CLC Genomics Workbench (CLC GWB) は、GUI (グラフィカルユーザーインターフェイス) 操作のみでNGS データ2次解析を可能にします。フリーツールを用いた解析の場合、複雑な解析ワークフローの構築にバイオインフォマティクスの専門知識を必要とすることが多く、また多様な解析目的に対応していません。CLC GWB は、多様な目的での NGS データ解析を可能にするツールで、コマンドラインの使用やコーディングも必要ありません。CLC GWB を用いれば、RNA-seq、変異解析、微生物関連解析といった多様な解析を同様の GUI 操作で行えるため新し解析法の習得が容易です。ユーザーは自由に解析に用いるリファレンス配列を変更でき、ワークフローを構成する各ツールの互換性に悩まされることもありません。これらの特徴は、CLC GWB が医学生物学研究のみならず、バイオ医薬品の品質管理にも 使用される理由になります。 【特徴】 ■GUI 操作での多様な NGS 2次解析 ■多様な目的での NGS 2次解析 ■有償・無償のプラグイン高拡張性 ■ウエット研究者使用可能メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン
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高い透明性でヒト生殖細胞変異の自動評価サポート・WGS/WES 由来の膨大な変異評価を高品質知識ベースで実施 QIAGEN Clnical Inaight (QCI) Interpret は、臨床的 NGS 検査実施機関や遺伝性疾患の研究機関のヒト生殖細胞変異評価の短時間化やスケールアップをサポートします。QCI Interpert は、約25年にわたりマニュアルキュレーションにより更新を続ける QIAGEN Knowledge Base (QKB)や遺伝性疾患の原因遺伝子変異の世界的データベース HGMD Professional など多様な知識ベースを活用しており、このことは QCI Interpret の透明性の高い意思決定サポート能力を支えています。QCI Interpret に収載される膨大な知見や情報は、国際的ガイドライン(ACMG/AMP など)に準拠した変異の評価やレポートの作成、その証拠となる引用文献の提示、VUS (意義不明の変異)の減少を可能にします。QCI Interpret は、検査機関や研究機関が変異情報から臨床的、診断的意義を見出す作業を、単純化、短時間化、低コスト化します。 【特徴】 ■証拠を示す変異評価の高い透明性 ■ガイドラインに準拠した評価メーカー・取扱い企業: 株式会社キアゲン