MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。 以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ■水素原子付加状態の決定 ■ポケット探索 ■フラグメント結合位置検索 ■結合部位中での分子設計 ■リガンド-受容体との相互作用解析 ■Potein-Ligand Interaction Fing...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

ドラッグデザインソフト『MolDesk Screening』

高速スクリーニング計算機能を持つドラッグデザインパッケージソフト

【機能概要】 ■入力ファイル：pdb、mol2、sdf、mol 　・mol2は、マルチmol2形式に対応 ■タンパク質の編集 　・水素原子付加、不要な部分の削除、未端処理など 　・エピゲノム修飾に使える40種類のアミノ酸変換 ■化合物の編集 　・化合物の新規作成や、既存分子の編集 　・2D構造から3D構造への変換、水素原子...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社バイオモデリングリサーチ

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス

NATURE'S ROBOTS　それはタンパク質研究の壮大な歴史

著者タンフォードが、タンパク質の疎水性の概念の形成についてその真髄を語…

　6 繊維状タンパク質 　7 分析の必要性 　8 アミノ酸配列 　9 サブユニットとドメイン Part 2 詳細な構造 10 タンク質ホールディングに関する初期のアプローチ 11 水素結合と a - ヘリックス 12 ラングミュアと疎水性を決めるもの 13 三次元構造 Part 3 生理機能 14 古代科学・多様な科学 15 酵素はタンパク質か？ 16 抗体...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社エヌ・ティー・エス

リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』

自動的にクオリティの高い図を作成！さまざまな画像フォーマットに対応しま…

『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類（水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用）を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力する...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社モルシス