GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレーション！同じプラットフォームのデータを横断的に発現解析 『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種：biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、（酵母、大腸菌） 【対応生物種：plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、（酵母、大腸菌） 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

マイクロアレイの特異的プライマー／プローブを効率的に設計するためのツール 下記の解析に対応しています。 ・マイクロアレイによる遺伝子発現解析 ・SNP検出 & SNP ジェノタイピング ・全ゲノムアレイ ・タイリングアレイ ・リシーケンシングアレイ

qPCRやマイクロアレイを使用した種同定 および分類群識別のための包括的なプライマー／プローブ設計ツール 下記の解析に対応しています。 ・異種/分類群識別 ・種同定 ・選択的スプライシング検出 ・エクソンジャンクションのプライマー設計 ・リアルタイムPCRプライマー設計 ・TaqManプローブ設計 ・SYBR Greenプライマー設計 ・Molecular Beacon設計 ・FRETプローブ設計 ・マイクロアレイプローブ設計 ・NEATアッセイ設計

リアルタイムPCRで効率的かつ特異的なオリゴを設計するための 包括的なプローブ／プライマー設計ツール 下記の解析に対応しています。 ・SYBR Greenプライマー設計 ・TaqManプローブ設計 ・マルチプレックスリアルタイムPCRアッセイ設計 ・HRMAプライマー設計 ・MethyLight TaqMan設計 ・Molecular Beacon設計 ・NASBAアッセイ設計 ・FRETプローブ設計 ・Scorpionsアッセイ設計

マルチプレックスPCRに特化したプライマー設計ツール 下記の解析に対応しています。 ・マルチプレックスSNP検出 ・ハイスループットジェノタイピング ・マルチプレックスPCRプライマー設計 ・包括的なアッセイサポート ・次世代シーケンシングアッセイ ・プライマーの特異性 ・プレデザインされたプライマー／プローブの評価 ・MagPlex TAGの追加

お客様の「調べたい」をDNA解析技術で解決！検査・調査に応用してみませんか？ ファスマックの『環境DNA解析』についてご紹介します。 「次世代シーケンサーを用いたDNAメタバーコーディング」では、 DNAバーコーディング領域を利用し、環境試料中の多様性解析を行います。 お客様独自のターゲット配列にも対応。お客様にてライブラリ調製を 行っていただき、当社にてランから解析まで承ります。 この他にも、生物の在不在評価や、生物量の推定にご利用いただける 「定量PCRによる種特異的解析」も承っております。 【特長】 ＜次世代シーケンサーを用いたDNAメタバーコーディング＞ ■DNAバーコーディング領域を利用し、環境試料中の多様性解析を行う ■ライブラリ調製用のプライマ―は無償提供 ■お客様独自のターゲット配列にも対応 ■DNA抽出やライブラリ調製から承ることも可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

オプション作業を承ることも可能！組み換え抗体の作製をサポートいたします ファスマックでは、『抗体配列シーケンス解析』を承っております。 抗体可変配列の取得により、組み換え抗体の作製をサポート。 ハイブリドーマに発現するマウスIgG遺伝子 可変配列を5’RACE法、 またはRT-PCRにより増幅、大腸菌でDNAクローニングを行い シーケンス解析します。 その他、場合によりその他オプション作業を承ることも可能です。 ご相談ください。 【解析詳細】 ■提供物：ハイブリドーマ　totalRNA 1μg(100ng/uli以上)又は細胞ペレット1×10^6cell ■納品物：報告書、シーケンス解析データ 　(H鎖とL鎖それぞれDNA10クローン分のデータを報告) ■納期：2～3週間 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

キャピラリーシーケンスや微生物同定など、当社のDNAシーケンス解析サービスをご紹介 北海道システム・サイエンス株式会社では、『受託DNAシーケンス解析サービス』 をご提供しております。 送付いただいたDNAサンプルのシーケンス解析を行う「キャピラリーシーケンス サービス」をはじめ、「Primer Walkingサービス」 「微生物同定サービス」「SNP解析サービス」をご用意。 また、オプションサービスもございます。 ご用命の際は、当社へお気軽にご相談ください。 【サービス内容（抜粋）】 ＜キャピラリーシーケンスサービス＞ ■送付いただいたDNAサンプルのシーケンス解析を行う ■サイクルシーケンス反応を1回行い、得られたデータを送付 ＜Primer Walkingサービス＞ ■プライマーウォーキング法による長鎖塩基配列を決定 ■解読した塩基配列からプライマー設計・合成、シーケンス解析を行う ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

植物種をDNA鑑定により同定 当社では、未知の植物サンプルがどの種に属するのかを、DNA鑑定により 同定するサービスをご提供しております。 植物種の同定によく使われる遺伝子領域をPCRで増幅し、塩基配列解析を実施。 得られた配列を公的データベースと照合して結果を報告いたします。 また、遺伝子領域としては原則として「ITS1」を用いております。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【検査方法】 1.植物種の同定によく使われる遺伝子領域をPCRで増幅 2.塩基配列解析 3.得られた配列を公的データベースと照合 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

DNA 配列のアセンブリとアラインメント CodonCode Aligner は、DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、突然変異の検出に役立つプログラムです。Aligner は、親しみやすく、分かり易いユーザーインターフェースを備えていながら、Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフルサポートする能力を備えています。

次世代シーケンサーとマイクロアレイの様々なデータ解析に対応！イルミナ／サーモフィッシャー／アジレントなど各社のデータに対応！ 『Partek Genomics Suite』は、次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを統合して解析できるソフトウェアです。数多くのアプリケーションに最適な解析アルゴリズムを搭載しており、幅広い研究目的にご利用いただけます。 【次世代シーケンサーの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析（RNA-seq） ■miRNA発現解析（miRNA-seq） ■ゲノムリシーケンス解析（DNA-seq） ■転写因子結合部位解析（ChIP-seq） ■メチル化部位解析（MeDIP-seq） 【マイクロアレイの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析／エクソン解析／miRNA発現解析 ■コピー数解析／アリル特異的コピー数解析／LOH解析 ■関連解析／トリオ解析 ■タイリングアレイ解析／イルミナメチル化アレイ解析 【対応機器】 ■イルミナの各種NGS／マイクロアレイ ■サーモフィッシャーの各種NGS／マイクロアレイ ※ライフテクノロジーズ、アフィメトリクスを含む ■アジレントの各種マイクロアレイ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

Partek社製ソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアライメントからパスウェイを使った生物学的解釈まで実行 　Partek社はNGSデータ解析ソフトウェアPartek Flow、NGS／マイクロアレイデータ解析ソフトウェアPartek Genomics Suite、パスウェイ解析ソフトウェアPartek Pathwayをリリースしています。これらのソフトウェアを組み合わせてRNA-seqのデータ解析をアラインメントからパスウェイを使った生物学的解釈まですべてサポートします。 　Partek FlowはFASTQファイルを読み込んで、アラインメント前後のQA/QC、参照ゲノム配列へのアラインメント、発現量の定量および正規化、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析、主成分分析や階層型クラスタリング、GOやパスウェイを使った生物学的解釈、ゲノムビューアーによる可視化などRNA-seqのデータ解析全般をサポートします。 　Partek Genomics SuiteはBAMファイルを読み込んで、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析に加えてアリル特異的発現解析、コーディング領域のSNV解析をサポートします。 　Partek PathwayはKEGGパスウェイ情報を使ったパスウェイ解析をサポートします。

データ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで幅広くご利用可能です 当資料では、『Partek Flow 8.0』の新機能を紹介しております。 『Partek Flow』は、次世代シーケンサーデータの解析から解析結果の 可視化までを行います。 搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース （GUI）上でパラメーターを選択しコマンドを実行。 そのためデータ解析の専門家からデータ解析が専門でない実験研究者まで 幅広くご利用いただけます。 【掲載概要】 ■Partek Flowの製品概要 ■擬時間解析 ■UMAP プロットによる次元削減 ■トライアル ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定を、短時間・高感度・低コストで実現。 『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能 ■独自技術により再現性の高い結果が得られる 【解析事例】 ◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析 少ないDNA量で素早く検出できるRAISING法の特長を活かし、 プロウイルス量0.032％でも高い検出感度を実現しています。 ◎ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出 CRISPR/Casで作製したノックインマウスについて、NGSとの組み合わせにより ノックイン効率とオフターゲットサイトの検出を行いました。 ※事例やサービスの詳細は「ダウンロード」から資料をご覧ください。

GenePrint24Systemを用いたSTR分析を実施！特定24か所のSTR遺伝子型を判定します ファスマックでは、『STR分析(細胞認証用)』を承っております。 GenePrint24System(プロメガ社)を用いたSTR分析を実施。 キットを用いたMultiplex PCR後に、キャピラリー電気泳動を行い、 CODISやESSローカス、Y染色体ローカス等を含めた特定24か所の STR遺伝子型を判定します。 ご報告するalleleデータを、公共データベース等との照合に 用いることで細胞認証ができます。 【詳細】 ■納期：1週間 ■お送りいただくもの ・DNAサンプル(20ng以上)　※冷蔵便または冷凍便でお送りください ・印刷したオーダーシート ■納品物 ・alleleデータ(エクセル)、波形データ(PDF/fsaファイル) ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

手持ちの配列にNCBIのBLASTが簡単に実行できるアプリケーションです。 インストール後、30日間無料お試しできます。 次世代シーケンサから得られたプライベートなmRNAやGenome、アミノ酸の配列に対して、WindowsやMacなどのモバイルPC上で、BLAST検索作業を簡単に行うことができるアプリケーションです。 ・インストーラで簡単インストール ・すべての機能をマウスで操作 ・複数の配列セットをデータベースとして登録 ・複数のクエリ配列とそのBLAST結果を保存 ・BLAST結果をPDFで出力、印刷 ・３０日間無料でBLAST可能 ・ライセンスが切れても、BLAST検索結果の参照は可能です。 ・BLAST結果を見るだけであればライセンスは必要ありません。