製品ランキング バイオインフォマティクス(2024-02-07 00:00:00.0~2024-02-13 00:00:00.0)
  1. リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現! 『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit(誘導適合)にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム 製品画像
  2. 薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価!プロパティー計算プラグイン 『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。 実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。 当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれており、計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでご契約いただけます。 【特長】 ■高いパフォーマンスと多様な活用法を実現 ■薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価 ■強力なリード生成・リード最適化ツール ■“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれている ■計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでできる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    高精度物性予想『Calculator Plugins』 製品画像
  3. イオン化され得るグループのpKaを計算!蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa(酸塩基解離定数)等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa:高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies:特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point:等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    pKa予測・分子種予測・等電点予測『Protonation』 製品画像
  4. logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います! 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    LogP予測,LogD予測『Partitioning』 製品画像
  5. 高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です! 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    水溶解度予測『Solubility』高精度で予測! 製品画像
  6. パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用意! パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin:パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin:コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin:分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    分子記述子計算『Structural Calculations』 製品画像
  7. NovaFold AI 第6位 閲覧ポイント2pt
    "AlphaFold 2" と "I-TASSER" の両方を搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア「NovaFold AI」 【世界最高峰のアルゴリズムを搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア】 DNASTAR社は、タンパク質構造予測のリーディングソフトウェアである NovaFold に、Google傘下のDeepMind社によって開発され ”AlphaFold 2” のAIシステムを組み込んだ新しいバージョンをリリースしました。”AlphaFold 2” を搭載した「NovaFold AI」を使用することにより、ユーザーは Protean 3D の既存の NovaCloud サービスのインターフェイス内で ”AlphaFold 2” のタンパク質構造予測手法をシームレスに利用して、アミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、その結果を視覚化して分析できます。
    メーカー・取扱い企業: シップスバイオサイエンス株式会社
    NovaFold AI 製品画像
  8. 遺伝子検査キット『ジェノプラン』 第6位 閲覧ポイント2pt
    健康増進のための必須ツール 『ジェノプラン』は、ご自身で唾液を採取することで、 簡単に遺伝子検査を行える遺伝子検査キットです。 業界最速クラスの10営業日で検査結果の閲覧が可能。 生活習慣改善に対する食生活・運動習慣・スキンケアなどを最適化できます。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【遺伝子検査手順】 1.唾液抽出&ウェブ登録 2.唾液配送 3.DNA抽出&分析 4.結果レポート閲覧 5.自身の遺伝子的特徴・リスクポテンシャルの把握 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。
    メーカー・取扱い企業: ジェノプランジャパン株式会社
    遺伝子検査キット『ジェノプラン』 製品画像
  9. GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレーション!同じプラットフォームのデータを横断的に発現解析 『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種:biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、(酵母、大腸菌) 【対応生物種:plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、(酵母、大腸菌) 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』 製品画像
  10. 次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストにKEGGパスウェイ情報を使って生物学的解釈を追加 『Partek Pathway』は、Partek Genomics Suiteで次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを解析して得られた遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているパスウェイを抽出できます。どのようなパスウェイが遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているかを知ることで実験結果に生物学的解釈を得ることができます。 また、『Partek Pathway』は遺伝子の発現情報から全体が協調して発現変動しているパスウェイや一部の遺伝子だけが発現変動していて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。 【対応する解析メニュー】 ■パスウェイエンリッチメント解析 ■パスウェイANOVA パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。(注)パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。 (注)Partek Inc.はKEGG Authorized Service Providerです。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    パスウェイ解析ソフトウェア『Partek Pathway』 製品画像
  11. 電子実験ノート『Scilligence ELN』 第9位 閲覧ポイント1pt
    低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    電子実験ノート『Scilligence ELN』 製品画像
  12. GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの遺伝子発現解析の結果を統合してPCSK9遺伝子の機能を解析 Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の特性を明らかにしました。また、PCSK9遺伝子と共発現する遺伝子を同定しています。 『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データをキュレーションしてアノテーションごとに解析できるようにした遺伝子発現データベースの検索エンジンです。非常に特異的なプロファイル(例えば、標的遺伝子やバイオマーカー)を持つ遺伝子を特定したり、選択した遺伝子の転写活性に関連した条件を見つけたりするために数千の実験を同時に解析できます。 このケーススタディの概要は以下の通りです。 ■遺伝子の機能解析と適応症の研究 ■モデル生物の選択 ■遺伝子のネットワーク解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析 製品画像
  13. 【電子実験ノート】BIOVIA Capture 第9位 閲覧ポイント1pt
    正確で確実なデータを簡単に入力でき、データ確認時間の短縮にも貢献! BIOVIA Captureは、実験実施計画書を簡単且つ正確に入力でき、データの確認時間も短縮できるため、多くの製薬企業で使用されています。
    メーカー・取扱い企業: ダッソー・システムズ株式会社
    【電子実験ノート】BIOVIA Capture  製品画像
  14. MI、第一原理計算の材料別ケースや各種手法の最新動向をリサーチした、新素材開発・創薬効率化、次世代ビジネスに向けた書籍です。 ■ 発  行:2024年1月12日 【本書の特徴】 ➢ Citrine InformaticsやEnthoughtなどのMI支援サービス企業と日本勢との開発動向! ➢ MIを活用した高分子材料、電池材料、金属・無機材料の特徴、ビジネス動向を掲載! ➢ 第一原理計算による、リチウムイオン電池や半導体材料などの材料別ケースを記載! ➢ スパースモデリングが注目される背景、大学研究、及び、導入している企業を紹介! ➢ MicrosoftやGoogle等のビッグテックや、AI搭載のソフトウエア企業の創薬事業とは? ➢ 量子コンピュータ、量子ソフトウエアとマテリアル開発との関係、材料開発を詳述! ➢ 素材産業における量子コンピューティングのユースケースの探求に関心が高まる!
    メーカー・取扱い企業: 株式会社シーエムシー・リサーチ
    『世界のマテリアルズ・インフォマティクス 最新業界レポート』 製品画像
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