製品ランキング バイオインフォマティクス(2024-02-21 00:00:00.0~2024-02-27 00:00:00.0)
  1. 低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    電子実験ノート『Scilligence ELN』 製品画像
  2. リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現! 『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit(誘導適合)にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム 製品画像
  3. 正確で確実なデータを簡単に入力でき、データ確認時間の短縮にも貢献! BIOVIA Captureは、実験実施計画書を簡単且つ正確に入力でき、データの確認時間も短縮できるため、多くの製薬企業で使用されています。
    メーカー・取扱い企業: ダッソー・システムズ株式会社
    【電子実験ノート】BIOVIA Capture  製品画像
  4. イオン化され得るグループのpKaを計算!蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa(酸塩基解離定数)等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa:高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies:特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point:等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    pKa予測・分子種予測・等電点予測『Protonation』 製品画像
  5. NovaFold AI 第1位 閲覧ポイント6pt
    "AlphaFold 2" と "I-TASSER" の両方を搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア「NovaFold AI」 【世界最高峰のアルゴリズムを搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア】 DNASTAR社は、タンパク質構造予測のリーディングソフトウェアである NovaFold に、Google傘下のDeepMind社によって開発され ”AlphaFold 2” のAIシステムを組み込んだ新しいバージョンをリリースしました。”AlphaFold 2” を搭載した「NovaFold AI」を使用することにより、ユーザーは Protean 3D の既存の NovaCloud サービスのインターフェイス内で ”AlphaFold 2” のタンパク質構造予測手法をシームレスに利用して、アミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、その結果を視覚化して分析できます。
    メーカー・取扱い企業: シップスバイオサイエンス株式会社
    NovaFold AI 製品画像
  6. 高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です! 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    水溶解度予測『Solubility』高精度で予測! 製品画像
  7. 抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能! 『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEの カスタムアプリケーションです。 抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、 配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの標準アプリケーションと組み合わせて、生物学的製剤の開発における 問題や課題をクリアにし、in-silicoを用いた合理的な分子設計が可能です。 【特長】 ■バイオ医薬品開発のためのカスタムアプリケーション ■従来のMOEのメニューにBio-MOEメニューを新規に追加し使用 ■より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行える ■生物学的製剤の開発における問題や課題をクリア ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』 製品画像
  8. LogP予測,LogD予測『Partitioning』 第7位 閲覧ポイント2pt
    logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います! 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    LogP予測,LogD予測『Partitioning』 製品画像
  9. Marvinライセンスで利用可能!分子の元素構成に関する値を計算・表示します パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass:molecular mass ■Exact mass:molecular mass calculated from the most frequent  natural isotopes of the elements ■Formula:chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    分子基本パラメータ計算『Elemental Analysis』 製品画像
  10. SampleManager LIMS ソフトウエア 第7位 閲覧ポイント2pt
    ラボのデータ、機器、およびワークフロー全てを管理するLIMSソフトウエア LIMS、すなわちラボラトリー情報管理システム(Laboratory Information Management System)は、サンプル、実験結果、ワークフローや分析機器に関連するデータを自動で収集し、分析するシステムです。 ラボにおける全てのデータを自動で収集することで、ラボの生産性や効率を向上させ、手入力によるミスや改ざんの防止によりコンプライアンスを強化し、企業のデータインテグリティを促進します。 Thermo Scientific SampleManager LIMS ソフトウエア は、LIMSだけでなく、電子ラボノート(ELN)、ラボ実行システム(LES)、科学データ管理システム(SDMS)の全てを兼ね備えたオールインワンソリューションです。 製薬・化学・金属・石油・食品など、さまざまな業界の生産における品質管理部門、そして研究開発(R&D)分野など、幅広い業界のラボでお使いいただいています。
    SampleManager LIMS ソフトウエア 製品画像
  11. GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレーション!同じプラットフォームのデータを横断的に発現解析 『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種:biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、(酵母、大腸菌) 【対応生物種:plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、(酵母、大腸菌) 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』 製品画像
  12. 孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能 MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル(液滴、周期境界条件) ■スケッチャーツールからの分子のコピー&ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション 製品画像
  13. 『MOE』抗体モデリング 第11位 閲覧ポイント1pt
    アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、ヒト化抗体の構築。抗原とのエピトープマッピングに対応。 統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の 入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。 相補性決定領域(CDR)を自動認識して配列アラインメントを行い、 それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。 予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。 【機能】 ■抗体データベース ■領域別のアノテーション ■抗体のための相同配列検索 ■抗体モデリング ■Ig 全長、fab、 Fv、sdAb、ヒト化抗体 ■表面パッチ解析 ■タンパク質ータンパク質ドッキング ■エピトープ・マッピング ■タンパク質の物性推算 ■ループ/リンカーモデリング ■MOE/webアプリケーション ■モデリングの自動化 カタログを刷新しました。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE』抗体モデリング 製品画像
  14. 『MOE』タンパク質変異体解析 第11位 閲覧ポイント1pt
    バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載 「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析(疎水性/電荷) ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE』タンパク質変異体解析 製品画像
  15. 腸内代謝物質のみの解析だけでは見出せない腸内環境の制御までを念頭においた腸内環境評価手法 『メタボロゲノミクス(R)』は、メタゲノム解析とメタボローム解析を 組み合わせ、腸内環境を統合的に評価する手法です。 得られた腸内環境の膨大な情報を統合的に解析するため、 アカデミアで培われた確かなビックデータ解析技術を基盤としています。 ※詳細についてはお気軽にお問い合わせください。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社メタジェン 本社/鶴岡研究所
    腸内環境評価手法『メタボロゲノミクス(R)』 製品画像
  16. hERG阻害予測ツール『hERG Predictor』 第11位 閲覧ポイント1pt
    信頼性の高いhERG阻害予測ツールで、心毒性リスクを創薬の早期に排除します! 創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    hERG阻害予測ツール『hERG Predictor』 製品画像
  17. パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用意! パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin:パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin:コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin:分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    分子記述子計算『Structural Calculations』 製品画像
  18. マイセルフ遺伝子検査 第11位 閲覧ポイント1pt
    遺伝子検査で体質を判定し、自身の遺伝子型に対応した的確な予防措置を取りましょう 『マイセルフ遺伝子検査』は、各種体質遺伝子(DNA)検査において、 潜在する体質確認のためのツールとしてご活用いただけます。 生活習慣病および各種がんリスク検査において、高齢化社会になり 発症のリスク患者が毎年増え続けております。 手軽にできて精度の高いスクリーニング検査としてご利用可能です。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【取扱製品】 ■各種体質遺伝子(DNA)検査キット ■子宮頸癌および性感染症(STD)検査キット ■生活習慣病および各種がんリスク検査キット ※詳しくはお気軽にお問い合わせください。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社プロップジーン
    マイセルフ遺伝子検査 製品画像
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