ゲノム編集ツール『GenomeCraft‐ドナーDNA』

ssODN合成、ssDNA作製、ターゲティングベクター作製をご紹介しま…

当社が取り扱う、ゲノム編集ツール『GenomeCraft‐ドナーDNA』をご紹介します。 「ssODN(一本鎖オリゴドナーDNA)合成」では、塩基置換やloxPサイト等、 数十塩基までの配列をノックインするドナーDNAとしてご利用可能。 「ssDNA(...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック

DNAランダムインテグレーション解析

短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析

外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺...

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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定…

『RAISING法』は、ゲノム中の外来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の...

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【次世代シーケンス解析事例】12Sアンプリコン解析

検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…

魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて 解析した例をご紹介いたします。 相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバ...

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【次世代シーケンス解析事例】生菌微生物群集構造解析

EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…

造解析(自社データ)をご紹介します。 大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと 処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに 対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。 その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって 熱処理したサンプルでは大腸菌はほとんど検出されませんでした。 ...

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【使用事例】ゲノム編集ツール『GenomeCraft』

ダブルノックアウトや、遺伝子ノックイン(マウス)などの使用事例をご紹介…

イン(マウス)”での使用事例もございます。 【In vitro digestion assay　使用事例】 ■実験内容 ・Cas9蛋白質とsｇRNA又はcrRNA+tracrRNA、基質DNA断片を混合し、 　DNA切断実験を行った ■結果：バンドのシフトが確認されたことから、sgRNA、 　crRNA+tracrRNAとも良好なDNA切断活性を確認 ※詳しくはPDF資料を...

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【次世代シーケンス解析事例】MLST解析　※解析事例集進呈中

環境DNAに混在した株を同定することができた解析事例をご紹介します！

数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。 当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した 試料(単離株のゲノムに環境DNAに混合したもの)を用意し、タイピングを実施。 用意した株はグラム陽性菌、グラム陰性菌で、これらのサンプルについて Miseqでゲノムシークエンス、タイピングを行いました。 その結果、...

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次世代シーケンス解析『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』

サンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archae…

コンティグのBLAST解析、Sequence Typeのタイピングをご用意しております。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【解析概要】 （1）お客様：抽出したゲノムDNAを当社にご送付 （2）当社：受領サンプルのQC作業を行う （3）当社：MiSeq解析用のアダプターライブラリを調製 （4）当社：MiSeqで2×300 bpランを行う （5）当社：取得デー...

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【解析事例】HTLV-1クロナリティ解析

高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ…

。 現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を 用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて おりますが、大量のDNA(血液)を要する、長時間で複雑な工程を必要とする、 検出感度は十分ではないなど種々の問題を抱えています。 RAIS法は、これらの問題を全て克服した方法であり、HTLV-1クロナリティ解析に...

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【次世代シーケンス解析事例】ジェノタイピング解析

次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行…

ンスなら細胞集団の変異を詳細に評価することが出来ます。 【事例概要】 ■CrispRvariantを用いた培養細胞のジェノタイピング ■CRISPR/Casでゲノム編集した培養細胞株からDNA抽出後、 　ターゲットアンプリコンシーケンスをMiseqにて実施 ■得られたデータをCrispRvariantにて解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...

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【解析事例】動物培養細胞、植物細胞の挿入部位の決定

RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配...

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【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出

ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します！

ISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの 検出を試みました。 ノックインに用いたドナーDNAが目的とした9番染色体(chr9)に加えて、 別の染色体へも挿入されていることが示唆されました。 【RAIS法によるランダムインテグレーション解析サービス 内容】 ■サンガーシーケンスプ...

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