タンパク質解析 | イプロス医薬食品技術

PRNMRとMD計算で低分子化合物とタンパク質の相互作用を評価できます。

生理活性化合物の中には、タンパク質を標的として作用する化合物が数多く存在します。そのため、低分子化合物とタンパク質間の相互作用について構造的な知見を得ることは薬剤の開発にとって非常に重要です。本資料では、NMRと分子動力学計算を用いて溶液中におけるL-トリプトファンとウシ血清アルブミン（BSA）の相互作用を解析した事例を紹介します。...詳しくは資料をダウンロード、またはお問い合わせくださ...

メーカー・取り扱い企業：一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

『MOE』タンパク質変異体解析

バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を…

「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単にタンパク質の特性解析が行えます。バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

強力な配列検索で特許調査を革新するPatsnap『Bio』

網羅性の高い配列検索で特許調査を革新

製薬、バイオテクノロジー、農業業界に特化したPatSnapのBioは、DNA、RNA、タンパク質配列の検索により、特許情報や豊富な非特許文献リソースを特定します。 Patsnapの特許検索・分析ツールAnalyticsと連携し、より詳細な特許の解析が可能です。高度なデータ処理技術と独自の検索 AI アルゴリズムで生物配列のFTOを飛躍的に改善し検索漏れリスクを低減します。【特長】 ■大規模な...

メーカー・取り扱い企業：パトコア株式会社

卓越した分子モデリング・シミュレーションソフトウェア『MOE』

創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォーム

『MOE』は、世界中で広く利用されている分子モデリングソフトウェアです。多彩な計算化学アプリケーション、分子構造データベース、開発環境を搭載しており、それらを組み合わせた適切なプローチでの分子設計が可能です。【特長】 ■低分子、タンパク質、抗体、ペプチド、DNA/RNA等の広範な分子スケールに対応 ■LBDD, SBDD, FBDDなど様々な分子設計手法に対応 ■目的に応じて使い分け...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

統合プロテオミクス解析ソフトウェア『PEAKS』

ボトムアッププロテオミクス対応！de novoシーケンシング・データベ…

『PEAKS』は、タンデム質量分析装置から得られたMS/MSスペクトルのボトムアッププロテオミクス対応の、統合的なプロテオーム解析ソフトウェアです。データベースサーチ機能では、既知タンパク質のデータベースと照らし合わせることによって、サンプル中に含まれるたんぱく質や、翻訳後修飾の解析を行うことが可能。 de novoシーケンシングやデータ検索を行うPEAKS Studio...

メーカー・取り扱い企業：インフォコム株式会社

タンパク質立体構造データベースシステム『PSILO2016.1』

タンパク質立体構造データ共有を支援！クオリティーサマリー表示なども可能…

「PSILO」は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。タンパク質立体構造データを整理して、多様な条件で検索可能にし、データの共有を支援します。公共データやインハウスデータなどの分散するタンパク質立体構造データを統合し、ウェブベースのインターフェースから容易に活用可能です。 2016年末にリリースされた『PSILO 2016.10』...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた分子モデリング・分子シミュレーション

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能

MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

GENEVESTIGATORを使ったPCSK9遺伝子の解析

GENEVESTIGATORを使って様々な研究室から登録された数多くの…

Nebion社の遺伝子発現データベースオンライン解析ツールである『GENEVESTIGATOR』を用いて、血中のLLDコレステロール量の調節にとって重要な酵素であるPCSK9遺伝子の様々な組織、細胞株、ガンでの発現調節やいくつかの生物種での発現変動の特性を明らかにしました。また、PCSK9遺伝子と共発現する遺伝子を同定しています。『GENEVESTIGATOR』は公共リポジトリーに登録され...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

MOEを用いた受容体構造に基づく分子設計(SBDD)

受容体構造を用いた化合物のドッキングシミュレーション

MOEを用いたStructure-Based Drug Design（SBDD）が可能です。標的タンパク質の適切な前処理、ポケット探索、ドッキングシミュレーション、ドッキングスコアによる評価、リガンド結合状態の解析を通して適切な分子設計とバーチャルスクリーニングを行えます。以下のような解析が可能です。 ■ドッキングシミュレーション ■受容体構造の確認と前処理（原子欠損の確認と修正） ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】MOEによる環状ペプチドの配座解析と相互作用解析

環状ペプチドにフォーカスした解析事例を掲載！

「MOE」は、低分子・ペプチド・タンパク質・抗体・核酸等の医薬品のモデリングに対応した統合計算化学プラットフォームです。広範なスケールの分子を同一環境で取り扱うことができ、環状ペプチドの配座解析、物性予測、相互作用解析などさまざまなアプローチでの設計が可能。当資料では、環状ペプチドにフォーカスしたMOEを用いた解析事例を紹介しています。【掲載内容（抜粋）】 ■...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE』抗体モデリング

アミノ酸配列からの抗体の自動モデリング。Ig、Fv、Fab、scFv、…

統合計算化学システム「MOE」の抗体モデリング機能では、抗体配列の入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。予測した抗体構造は、抗原との親和...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【資料】バイオ・抗体創薬のための統合シミュレーションソフトウェア

モノクローナル抗体、ワクチン抗原、酵素、ペプチドなど、多様なバイオロジ…

シュレーディンガーのバイオロジクス・抗体創薬ツールは、バイオロジクスの多岐にわたる高度なシミュレーションにより、開発期間の短縮に貢献します。一例として、下記のような機能がございます。 ■タンパク質立体構造モデリングを用いた実験値予測と解析 ■FEP計算を用いた高精度な予測技術 ※詳しくは、お気軽にお問い合わせ下さい。 ...BioLuminate 弊社のタンパク質構造モデ...

メーカー・取り扱い企業：シュレーディンガー株式会社

バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』

抗体やペプチドに対して、より高度なモデリングと物性評価が可能！

『Bio-MOE』は、バイオ医薬品開発のために作成されたMOEのカスタムアプリケーションです。抗体の自動モデリング、バイスペシフィック抗体の構築、タンパク質表面特性の pH 依存性、タンパク質のDevelopabilityの評価、ヒト化モデリング、バックミューテーション解析、配列と構造に基づいたLiabilityの検出など、より高度なモデリングと物性評価を簡単な操作で行えます。 MOEの...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

透過電子顕微鏡シミュレーションソフト　BioNet BesTEM

TEM/STEM像を忠実にシミュレート！タンパク質試料やウイルスにも対…

『 BioNet BesTEM（バイオネットベステム）』は、日本電子株式会社（JEOL）や、米FEI社をはじめとする国内・海外製の6極子型収差補正電子顕微鏡もシミュレート可能な、透過電子顕微鏡画像シミュレーションソフトです。収差補正電子顕微鏡が持つ光学系の影響を考慮したビーム強度、 Ronchigram（ロンチグラム）が計算可能。マテリアル系のシミュレーションだけで...

メーカー・取り扱い企業：株式会社バイオネット研究所

DNASTAR Lasergene

すべての生命科学者のためのソフトウェア

DNASTAR社 Lasergene は、最先端の研究を行う生命科学者のための革新的で使いやすいデスクトップソフトウェアです。分子生物学、ゲノミクス、構造生物学の研究に必要なすべてのツールを備えており、バーサタイルなフルパッケージまたは各分野に必要なツールをまとめたスイートパッケージとして利用できます。1984年以来ソフトウェア開発を続け、現在では全世界90か国以上にユーザーを持っています。Las...

メーカー・取り扱い企業：シップスバイオサイエンス株式会社

『MOE』結合部位における溶媒解析

3D-RISM 法に基づいて分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解…

MOE に搭載されているSolvent Analysis は、3D-RISM 法に基づいて、分子周辺の水分子の役割を高速かつ高精度に解析することができます。分子系における水分子の確率密度分布を計算し、さらに結合自由エネルギーにおける水分子の寄与を計算します。 Solvent Analysis は溶媒効果を可視化することで、タンパク質－リガンド間の相互作用の理解と新規リガンド設計を...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム

リガンドの結合様式を予測！より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現！

『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【日本語資料】先進技術を駆使して挑む､効率的なバイオ医薬品設計

プロジェクトニーズに合わせたワークフローでバイオ医薬品をデジタル設計

シュレーディンガーの最先端コンピュータモデリング技術とエンタープライズ･インフォマティクスプラットフォームを使うことで､モノクローナル抗体､ワクチン､酵素､ペプチドなど､高品質のバイオ医薬品の合理的設計が可能になります。 -タンパク質構造の予測、そのリファインメントとダイナミクス -物性の問題検出と軽減 -タンパク質相互作用の予測と解析 -In Silico Mutagen...

メーカー・取り扱い企業：シュレーディンガー株式会社

【資料】X線結晶解析

【ホワイトペーパー進呈】X線実験から生成される複合体構造データの解釈を…

当資料では、「BIOVIA Discovery Studio」での X線結晶解析について詳しくご紹介しています。「BIOVIA Discovery Studio」のモデリングツールは、X線実験から生成される複合体構造データの解釈を支援するように設計されています。「BIOVIA Discovery Studio」は、タンパク質-リガンド複合体の構造モデルを構築して精密化する...

メーカー・取り扱い企業：ダッソー・システムズ株式会社

「MOEの分子構造データベースと創薬への活用」の資料進呈

『MOEの分子構造データベースと創薬への活用』技術資料を配布中！

「MOE」は、創薬研究・生命科学研究のためのアプリケーションを統合した計算化学プラットフォームです。アプリケーションの実行環境のみならず、分子構造データベース機能や開発環境も統合されているのが大きな特長です。アプリケーションとして、ドッキングシミュレーション、分子動力学計算、 SAR解析、ライブラリー解析、フラグメント創薬ファーマコフォア解析、タンパク質モデリング、変異体解析等が搭載...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【セミナー情報】MOEフォーラム2017開催報告

MOEの最新技術の紹介と5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して…

『MOEフォーラム2017』では、開発元からMOEの最新技術の講演、5名の先生方にMOEを活用した創薬研究に関して講演いただきました。【開発元講演】 ■Prediction of Protein-Protein Binding Sites and Epitope Mapping ■Optimizing Protein Properties in the Cloud with MOE 【招待講...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

BIOVIA Discovery Studio ビジュアライザー

【ホワイトペーパー進呈】データを可視化・共有・解析できる立体分子可視化…

「BIOVIA Discovery Studio Visualizer」は、タンパク質や低分子のデータを可視化・共有し、解析するための立体分子可視化ツールです。「BIOVIA Discovery Studio Visualizer」は、低分子用・高分子用両アプリケーションに対する、機能豊富な分子モデリング環境です。エキスパート向けモデリング製品である、新リリースの「BI...

メーカー・取り扱い企業：ダッソー・システムズ株式会社

中分子創薬研究を加速するBIOVIAのソリューション

新たなモダリティとして注目されている中分子創薬研究のBIOVIAのソリ…

公開ページ： http://accelrys.co.jp/solutions/collaborative-science/MIDDLE-MOLECULAR/ 近年、医薬品開発のターゲットとして、従来の有機低分子化合物、抗体などのタンパク質製剤に加えて、サイズ的にはこれらの中間にあたる、いわゆる中分子が新たなモダリティとして注目されています。ダッソー・システムズ・バイオビアは、低分子化合物...

メーカー・取り扱い企業：ダッソー・システムズ株式会社

MOE Extensions for KNIME Ver.2.4

MOEノードまたは既存のノードを組み合わせてワークフローを作ることで解…

KNIMEは、オープンソースのデータ分析やレポート作成を行うための統合プラットフォームです。MOE Extensions for KNIME は、MOEを計算エンジンに用いたKNIMEノードの総称で、Ver. 2.4.0では180を超える解析ノード(MOEノード)が提供されます。ユーザーは、KNIME上で各種MOEノードを組み合わせて、化合物処理、QSAR解析、ファーマコフォア検索、ドッキ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

統合計算化学システム『MOE』核酸モデリング

統合計算化学システム『MOE』の核酸モデリング機能

『MOE』は、柔軟な核酸モデリングが可能です。二本鎖および一本鎖核酸を容易にモデリングでき、修飾核酸にも対応。塩基配列のセンス、アンチセンス表示や塩基配列のアライメント、核酸構造の重ね合わせも可能です。また、構築した核酸の物性推算や、ドッキング計算による核酸-タンパク質複合体の構造予測ができます。核酸の配列・立体構造・相互作用・物性を相互に関連付けて解析すること...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

Octetアプリケーション『GxP規制環境下でのアッセイ』

GxPに準拠したツールと簡便なオペレーションにより、規制環境下における…

規制上の要件として、堅牢かつGMP条件下で適切に適格性評価および検証された方法を使用して、バイオ医薬品をQCテストする必要があります。生体分子間相互作用解析Octetシステムは、インプロセステストおよびロットリリース試験のメソッド開発を促進する信頼性の高いシステムで、容易にQCへの移管が可能です。Easy to useとハイスループットの特徴により、特定のGMPアプリケーションにおいて、ELISA...

メーカー・取り扱い企業：ザルトリウス・ジャパン株式会社

【新製品情報】PSILO 2022.02の新機能

創薬研究を支援！PSILO 2022.02で追加される新機能をご紹介

『PSILO』は、生体高分子やタンパク質-リガンド複合体構造情報のデータベースシステムです。公共データやインハウスデータを統合的に管理し、独自の検索機能や解析機能により創薬研究を支援します。 PSILO 2022.02では、データベースの連携機能が新たに追加されました。さらに、構造バリデーション機能やタンパク質ファミリーの管理機能が強化され、より便利に使いやすくなりま...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

ターゲット・作用機序予測プラットフォーム『CLARITY』

化合物の有効性と安全性のプロファイルを解明！より包括的な予測が可能に！

『CLARITY』は、化合物の有効性と安全性のプロファイルを解明して作業仮説の立案に役立つ先進的な予測分析プラットフォームです。化合物の構造から有効性や安全性に関わる作用機序の活性、毒性や安全性およびADMEパラメーター全般、代謝物とその薬理学的影響といった広範なプロファイリングを予測します。化合物ライブラリーのバーチャルスクリーニング、標的タンパク質決定後の解析、...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

インシリコ創薬技術の資料進呈

創薬研究書籍の抜刷記事を配布中！

『MOE』は、創薬・生命科学研究のための分子モデリング、シミュレーションソフトウェアです。直観的に操作できる多彩なアプリケーションと豊富なデータコンテンツで、計算化学者から実験研究者まで、幅広いユーザーの研究をサポートします。国内外で多くの導入実績があり、分子シミュレーション、ケモインフォマティクス、タンパク質・抗体・ペプチドモデリング、立体構造に基づく分子設計、ファーマコ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

IT技術『ライフサイエンス分野における実験研究サポート』

薬剤候補化合物探索のための実験を速やかに開始できるようにサポート

株式会社バイオモデリングリサーチは、ライフサイエンス分野における実験研究をIT技術を用いて支援します。薬剤候補化合物探索のための実験を速やかに開始できるように、ドッキング計算から実験開始までをサポートします。バイオモデリングリサーチは、公益財団法人計算科学振興財団が運用しているFOCUSスパコン、および東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターのHGCスパコンを利用しており、500コア以...

メーカー・取り扱い企業：株式会社バイオモデリングリサーチ

高速ドッキングシミュレーションツール『FlexX』

ポケット中で化合物配座をフラグメント単位で再構築することでリガンドと受…

『FlexX』は、タンパク質のリガンド結合部位に、医薬候補化合物をフラグメント単位で配置することで高速に化合物のドッキング構造を予測するプログラムです。結合部位に化合物群を順次配置しリガンド候補を絞り込むバーチャルスクリーニングや、リガンド-受容体間の相互作用解析に利用できます。【特長】 ■多様な分子系に対応 ■高速ドッキング ■ファーマコフォアフィルター ■S...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

創薬モダリティの多様性に対応したソフトウェア《動画＆資料提供》

創薬モダリティに興味のある方必見！ 3つのライフサイエンスソフトウェア…

《情報計算化学生物学会 2020 年大会で開催したモルシス企業セミナーの動画のリンクと資料をご提供します。》創薬モダリティの多様化に伴い、創薬研究支援ソフトウェアにはモダリティに対応した機能が求められています。弊社取り扱い製品の中から「統合計算化学システム MOE」、「研究情報管理統合プラットフォーム Scilligence」、「医薬品安全性情報ポータル OFF-X」の３製品について創薬モ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

DNAStar

完全な配列解析のための包括的なソリューションを提供しています！

『DNAStar』は、生命科学者向けに、革新的で使いやすいデータ分析ソフトウェアツールを提供しております。先駆的なバイオインフォマティクスソフトウェアは、分子生物学、タンパク質、ゲノミクスの製品を中心とした完全な配列解析のための包括的なソリューションを提供。主要製品には、Protein、Lasergene Genomicsが含まれます。【ライセンス】 ■Las...

メーカー・取り扱い企業：株式会社B7

【セミナー情報】MOEフォーラム2020 開催報告

統合計算化学システム！5名の先生方にMOEを活用した研究事例についてご…

当資料では、日英同時通訳付きウェビナーとして開催した「MOEフォーラム2020」の招待講演と開発元の講演を紹介します。生命科学、創薬研究の分野の先端で活躍されている5名の先生方に MOEを活用した研究事例についてご講演いただきました。また、開発元のCCG社からは、対話的なSAR解析が行える MOEウェブアプリケーションのMOEsaicの機能強化、タンパク質の開発可能性や...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術資料】CITE-seqデータ解析『Partek Flow』

幅広くご利用可能！Flowを用いたCITE-seqデータ解析について紹…

『Partek Flow』は次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。次世代シーケンサーから出力されたリード配列を読み込んで、RNA-seqや DNA-seq、ChIP-seq、Metagenomics等のデータ解析が可能。搭載されているすべての解析ツールをグラフィカルユーザーインターフェース上で選択でき、複雑なコマンド入力が不要なので、データ解析の専門家からデータ解...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

『MOE 2016.08』新機能のご案内

タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載

「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加されました。Matched MolecularPair（MMP）解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス

【技術情報】遺伝子発現データベース　GENEVESTIGATOR

使いやすいインターフェースと高速な検索エンジンを搭載！実験条件の検索例…

『GENEVESTIGATOR』は、遺伝子発現データベースのオンライン解析ツールです。公共データベースに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレートすることで、様々な研究者により登録された大量の実験結果を統合して解析可能にします。当資料では、遺伝子発現変動データの検索や、タンパク質ACE受容体の発現レベルが高い実験条件の検索例について...

メーカー・取り扱い企業：株式会社モルシス