製品ランキング バイオインフォマティクス(2024-01-03 00:00:00.0~2024-01-09 00:00:00.0)
  1. バイオロジクス研究のためのタンパク質デザイン機能やタンパク質解析機能を搭載 「MOE」のタンパク質デザイン機能は、タンパク質立体構造データをもとに網羅的に変異体モデルを構築し、さらに変異による物性値への影響を予測します。 その他に、タンパク質解析の為の様々な機能が搭載されており、簡単に タンパク質の特性解析が行えます。 バーチャルファージディスプレイによりある物性にフォーカスしたタンパク質/ペプチドライブラリーの構築が可能です。 【タンパク質デザイン機能】 ■Alanine Scan ■Disulfide Scan ■Resistance Scan ■Residue Scan ■Sample Sequence ■Sequence Design 【特性解析】 ■親和力計算 ■熱安定性予測 【タンパク質解析機能】 ■タンパク質-タンパク質ドッキング ■ループモデリング/リンカーモデリング ■物性推算 ■表面パッチ解析(疎水性/電荷) ■ラマチャンドランプロット解析 ■接触表面積解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE』タンパク質変異体解析 製品画像
  2. NovaFold AI 第1位 閲覧ポイント7pt
    "AlphaFold 2" と "I-TASSER" の両方を搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア「NovaFold AI」 【世界最高峰のアルゴリズムを搭載したタンパク質構造予測ソフトウェア】 DNASTAR社は、タンパク質構造予測のリーディングソフトウェアである NovaFold に、Google傘下のDeepMind社によって開発され ”AlphaFold 2” のAIシステムを組み込んだ新しいバージョンをリリースしました。”AlphaFold 2” を搭載した「NovaFold AI」を使用することにより、ユーザーは Protean 3D の既存の NovaCloud サービスのインターフェイス内で ”AlphaFold 2” のタンパク質構造予測手法をシームレスに利用して、アミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、その結果を視覚化して分析できます。
    メーカー・取扱い企業: シップスバイオサイエンス株式会社
    NovaFold AI 製品画像
  3. ラボのデータ、機器、およびワークフロー全てを管理するLIMSソフトウエア LIMS、すなわちラボラトリー情報管理システム(Laboratory Information Management System)は、サンプル、実験結果、ワークフローや分析機器に関連するデータを自動で収集し、分析するシステムです。 ラボにおける全てのデータを自動で収集することで、ラボの生産性や効率を向上させ、手入力によるミスや改ざんの防止によりコンプライアンスを強化し、企業のデータインテグリティを促進します。 Thermo Scientific SampleManager LIMS ソフトウエア は、LIMSだけでなく、電子ラボノート(ELN)、ラボ実行システム(LES)、科学データ管理システム(SDMS)の全てを兼ね備えたオールインワンソリューションです。 製薬・化学・金属・石油・食品など、さまざまな業界の生産における品質管理部門、そして研究開発(R&D)分野など、幅広い業界のラボでお使いいただいています。
    SampleManager LIMS ソフトウエア 製品画像
  4. logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います! 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    LogP予測,LogD予測『Partitioning』 製品画像
  5. DNA 配列のアセンブリとアラインメント CodonCode Aligner は、DNA バーコーディング、シーケンスのアセンブリやコンティグの編集、突然変異の検出に役立つプログラムです。Aligner は、親しみやすく、分かり易いユーザーインターフェースを備えていながら、Phred-Phrap と互換性のあるシーケンスのクオリティスコアをフルサポートする能力を備えています。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社ヒューリンクス
    DNA 配列のアセンブリ 『CodonCode Aligner』 製品画像
  6. GEOなどに登録されたマイクロアレイやRNA-seqのデータをキュレーション!同じプラットフォームのデータを横断的に発現解析 『GENEVESTIGATOR』は、GEOやArrayExpressなどの公共リポジトリーに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの膨大な遺伝子発現データをキュレーションすることで、様々な研究者が登録した大量の実験結果を統合して解析可能にする遺伝子発現データベースです。 【対応生物種:biomedical】 ヒト、マウス、ラット、サル、イヌ、ブタ、ショウジョウバエ、(酵母、大腸菌) 【対応生物種:plant】 シロイヌナズナ、オオムギ、イネ、コムギ、トウモロコシ、ソルガム、ヒメツリガネゴケ、ダイズ、ウマゴヤシ、トマト、タバコ、(酵母、大腸菌) 研究者が標的遺伝子の探索などの遺伝子発現解析を行う際に、注目する遺伝子の同定や発現変動遺伝子の優先順位付けなどを簡単かつ正確に行うことができます。 【主な活用分野】 ■機能ゲノム科学 ■標的遺伝子の優先順位付け ■バイオマーカーの同定 ■発現変動遺伝子リストの解釈 ■遺伝子調節ネットワークの解析 ■実験計画の改善 ■ドラッグ・リポジショニング ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    遺伝子発現データベース『GENEVESTIGATOR』 製品画像
  7. 電子実験ノート『Scilligence ELN』 第5位 閲覧ポイント2pt
    低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    電子実験ノート『Scilligence ELN』 製品画像
  8. リガンドの結合様式を予測!より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現! 『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit(誘導適合)にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE-ASEDock』高精度ドッキングプログラム 製品画像
  9. 農業・環境関連製品システム 第9位 閲覧ポイント1pt
    有機培地に給液した排液を回収し、養液灌水再生液として供給する循環型システムです。 1.複合発酵型循環システム 2.金属イオン型循環システム
    農業・環境関連製品システム 製品画像
  10. 次世代シーケンサーとマイクロアレイの様々なデータ解析に対応!イルミナ/サーモフィッシャー/アジレントなど各社のデータに対応! 『Partek Genomics Suite』は、次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを統合して解析できるソフトウェアです。数多くのアプリケーションに最適な解析アルゴリズムを搭載しており、幅広い研究目的にご利用いただけます。 【次世代シーケンサーの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析(RNA-seq) ■miRNA発現解析(miRNA-seq) ■ゲノムリシーケンス解析(DNA-seq) ■転写因子結合部位解析(ChIP-seq) ■メチル化部位解析(MeDIP-seq) 【マイクロアレイの対応アプリケーション】 ■遺伝子発現解析/エクソン解析/miRNA発現解析 ■コピー数解析/アリル特異的コピー数解析/LOH解析 ■関連解析/トリオ解析 ■タイリングアレイ解析/イルミナメチル化アレイ解析 【対応機器】 ■イルミナの各種NGS/マイクロアレイ ■サーモフィッシャーの各種NGS/マイクロアレイ ※ライフテクノロジーズ、アフィメトリクスを含む ■アジレントの各種マイクロアレイ ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    Partek社のNGS/マイクロアレイデータ解析ソフトウェア 製品画像
  11. リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolveIT社製ツール 『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの 投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を 高速に求めるツールです。 また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに 化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。 配置は、ファーマコフォアの投影点の一致(水素結合、イオン結合、疎水性相互作用)と vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。 【特長】 ■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う ■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う ■参照リガンドは剛体として評価 ■オプションモジュール:FlexS-C ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    分子高速アラインメントツール『FlexS』 製品画像
  12. 類似構造検索やリガンドのデノボデザインを行う創薬支援ツール 『FTrees』は、既知の活性化合物と類似した構造を化合物データベースの 中から検索するBioSolveIT社製のツールです。 ヒットした構造は官能基の物理化学的な特徴とその位置が保存されており、 化学者が直感的に類似していると考える構造を高速に見出すことができます。 当製品は、従来のフィンガープリントを利用した方法では難しかった分子の トポロジーが保存された構造を探索することができ、Scaffold Hopping へ の適用(新規母核構造の発見)も可能です。 【特長】 ■典型的な化合物カタログに対する検索が標準的なPCを使って15秒程度で終了します ■フィンガープリントベースで類似度が低いと判断された化合物を、 FTrees記述子を用いたファジー検索では高い類似度でヒットします ■重ね合わされた構造から、共通の官能基(または異なる官能基)を明らかにします ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    ファジー類似構造検索ツール『FTrees』 製品画像
  13. 自動的にクオリティの高い図を作成!さまざまな画像フォーマットに対応します 『PoseView』は、リガンド-タンパク質間の相互作用の 2 次元図を作成するためのツールです。 相互作用しているアミノ酸の種類や原子、相互作用の種類(水素結合、 疎水性相互作用、π-π相互作用)を分かりやすく 2 次元で表示することができます。 操作はタンパク質構造とリガンド構造を入力するだけで、得られた図は 各種画像フォーマットで出力することが可能 。作成された図は、多くの 論文で活用され、Protein Data Bankの公式の相互作用図としても採用 されております。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    リガンド-受容体相互作用 2 次元図『PoseView』 製品画像
  14. FBLDツール『ReCore』 第9位 閲覧ポイント1pt
    置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支援ツール 『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    FBLDツール『ReCore』 製品画像
  15. 『MOE 2016.08』新機能のご案内 第9位 閲覧ポイント1pt
    タンパク質デザイン機能やタンパク質解析の為の様々な機能が搭載 「MOE 2016.08」には新規アプリケーションとして「MOEsaic」が追加 されました。Matched MolecularPair(MMP)解析やR-group 解析などの SAR 解析、分子設計、文書作成が行えるウェブアプリケーションです。 「MOEsaic」を用いることで、重要な置換基の検出、キー化合物の発見、 新規化合物の設計、解析で得られた知見の記録が効率的かつ直感的に行えます。 【MOEsaic 機能】 ■リガンド解析とSAR解析のためのWebアプリケーション ■部分構造と類似構造検索 ■R-group解析とプロファイリング ■Matched Molecular Pair解析(MMPs) ■新規バーチャルリガンドデザイン ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    『MOE 2016.08』新機能のご案内 製品画像
  16. ビッグデータに隠された情報と相互関係の発見、解明に威力を発揮し、あらゆる分野の問題を迅速に解決しています。 多変量統計解析、スペクトル解析、実験計画と最適化、知覚・官能データの解析、PATなどをテーマにトレーニングコースを開催しております。 産業界、研究界で希求される多変量統計解析の運用能力。本コースでは、複雑なデータの関係性の速やかな解釈、最新の多変量統計解析技術の業務応用能力を獲得できます。数学的な説明は最小限に抑え、実践的な内容です。本コースを修了されると、多変量統計解析を使った製品・プロセスの最適化、差異分析・分類、予測定量をスムーズに業務応用できます。 集合研修、インハウスセミナーを実施しています。 集合研修: 2日間トレーニングセミナー 多変量統計解析を用いた理論と実例 産業界、研究界で希求される多変量統計解析の運用能力。本コースでは、複雑なデータの関係性の速やかな解釈、最新の多変量統計解析技術の業務応用能力を獲得できます。数学的な説明は最小限に抑え、実践的な内容です。本コースを修了されると、多変量統計解析を使った製品・プロセスの最適化、差異分析・分類、予測定量をスムーズに業務応用できます。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社クオリテイデザイン
    多変量統計解析 トレーニングセミナー 製品画像
  17. 糖鎖および糖ペプチドの質量分析データを用いたグライコミクス向けツール 主要メーカーの質量分析計から得られたMS/MSおよびMSnデータを自動で読み取り糖鎖構造を予測します。さらに、LC-MS/MSデータを用いた糖ペプチド分析を包括的にサポートします。SimGlycanは実験で得られたMS/MSデータを独自のデータベースと照合し、最終的に候補構造のリストをランク付きで生成します。
    メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
    『SimGlycan』 糖鎖&糖ペプチド構造解析ソフトウェア 製品画像
  18. 脂質の質量分析データを用いたリピドミクス向けソフトウェアツール LC-、MALDI-、ESI-、プリカーサーイオンスキャン、ニュートラルロススキャンなどのMSデータから脂質種をハイスループットに同定および定量できます。Triple Quad、qTOF、TOF、QqTOF、イオンモビリティ、 ITMSのシステムなど、主要な質量分析メーカーのデータタイプをすべてサポートしており、ディスカバリーリピドミクスとターゲットリピドミクスの研究のための完全なソリューションを提供することを目指しています。
    メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
    『SimLipid』 脂質構造解析ソフトウェア 製品画像
  19. BaseSpace 『Cohort Analyzer』 第9位 閲覧ポイント1pt
    コホート・臨床ゲノム解析を支援する 臨床・創薬研究者のための最強ビッグデータプラットフォーム 医療分野のBig Dataは新医療技術創生の強力なテクノロジーとして期待されています。BaseSpace Cohort Analyzerは各種がん患者、自己免疫患者などの診療データ、治療の履歴と各種のオミックスデータを検索することができ、さらにさまざまな解析ツールによって患者の特性に応じた薬剤の効果を研究することのできる画期的なMedical Big Dataシステムです。また、Observational Studiesの情報は、最新の医療現場で早期診断やオーダーメイド医療への活用に利用されています。BaseSpace Cohort Analyzerは各種がん患者、自己免疫患者などの診療データ、治療の履歴と各種のオミックスデータを検索することができ、さらにさまざまな解析ツールによって疾患の原因となる遺伝子の変異や動態の詳細を解明し、治療のアドバイスを得られる画期的なシステムです。
    メーカー・取扱い企業: セレスバイオサイエンス株式会社
    BaseSpace 『Cohort Analyzer』 製品画像
  20. 化合物ライブラリーから高速検索可能!類似構造検索にも対応のMOEアドオンツール 『MOE-QFSS』は、複数の巨大な化合物ライブラリーから、高速かつ横断的に 構造検索を行うためのMOEのアドオンツールです。 リレーショナルデータベースを使用することなく、ユーザーはMOEのみで 高速な分子構造検索が可能です。 高速な化合物検索を通して、分子設計やバーチャルスクリーニングの現場を 強力に支援します。 【特長】 ■部分構造の超高速検索 ■類似構造検索に対応 ■分子記述子フィルター ■化合物ライブラリーの追加 ■連続検索に対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    統合計算化学システムMOE:アドオンツール『MOE-QFSS』 製品画像
  21. ビッグデータに隠された情報と相互関係の発見、解明に威力を発揮し、様々な分野の問題を迅速に解決します! 多変量統計解析、スペクトル解析、実験計画と最適化、知覚・官能データの 解析、PATなどをテーマにトレーニングコースを開催しております。 京都伏見にてトレーニングコースを受講頂くかオンラインにて受講頂くか ご選択できます! ■開始日時:12/9(木)~10(金)の2日間 産業界、研究界で希求される多変量統計解析の運用能力。本コースでは、複雑な データの関係性の速やかな解釈、新しい多変量統計解析技術の業務応用能力を 獲得できます。数学的な説明は最小限に抑え、実践的な内容です。本コースを 修了されると、多変量統計解析を使った製品・プロセスの最適化、差異分析・分類、 予測定量をスムーズに業務応用できます。集合研修、インハウスセミナーを実施 しています。 【トレーニングコースの内容】 ・多変量解析とは      ・回帰分析 ・主成分分析:PCA      ・バリデーション ・アウトライヤー(外れ値) ・未知試料の予測 ・データのチェック     ・回帰分析でのアウトライヤー ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社クオリテイデザイン
    多変量統計解析トレーニングセミナー京都伏見開催+オンライン受講有 製品画像
  22. 互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成!ヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須 パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin:立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin:互変異性体の計算 ■Resonance:共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    立体異性体、互変異性など、各種異性体構造の生成『Isomers』 製品画像
  23. 高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です! 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
    メーカー・取扱い企業: パトコア株式会社
    水溶解度予測『Solubility』高精度で予測! 製品画像
  24. 雑誌掲載記事の別刷進呈! 電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや、分析化学分野での活用法などを紹介 実験においては、参考文献、標準手順書、使用する試薬や機材の情報、行った作業内容やその際の観察結果、分析機器からの出力など、多種多様な情報を扱います。 電子実験ノート(ELN)は、これらの情報を適切に管理し、有効活用するためのシステムです。 CDD Vault ELNは創薬研究をはじめ様々な分野の実験を柔軟に記録することができるクラウド型ELNで、サンプル・アッセイ情報管理システムCDD Vaultのオプションモジュールです。 CDD Vaultは企業・大学・公的研究機関などでの多数の導入実績のほか、複数の組織による共同研究プロジェクトの情報共有プラットフォームとしての採用事例もあります。 現在、ELNのメリットや『CDD Vault ELN』の特長が紹介された記事 『クラウド型電子実験ノートによる研究データの統合的管理 ―CDD Vault ELNの紹介―』 の別刷資料を進呈中です。 「お問い合わせ」より「別刷送付希望」とご記入の上お申し込みください。 ※製品の詳細は『PDFダウンロード』よりカタログをご覧ください。
    メーカー・取扱い企業: 株式会社モルシス
    電子実験ノート(ELN)による研究データ管理の資料進呈 製品画像
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