クラウド型電子実験ノートによる研究データ管理のメリットや活用例として、CDD社の「CDD Vault」の特長や事例を紹介 株式会社技術情報協会から2023年12月27日に『実験の自動化・自律化によるR&Dの効率化と運用方法 －AI、ロボット技術、ChatGPT、MI、ベイズ最適化、秘密計算など－』が発刊されました。 本書では、ラボラトリーオートメーションに関する技術や環境・体制構築のポイント、応用事例などが多数紹介されています。詳細な執筆者や目次については出版社のウェブサイトをご参照下さい。 第3章「自動・自律実験の運用における組織体制と社内展開の仕方」の第8節「クラウド型電子実験ノートを活用した研究データの統合的管理」にて、クラウド型電子実験ノートによる研究データの統合的管理のメリットの説明と、その具体例としてCDD Vaultの機能と利用事例の紹介を行っています。 本節の詳しい内容にご興味がある方に抜刷を進呈致します。お問い合わせボタンから「抜刷送付希望」とご記載いただきお問い合わせ下さい！ 「PDFダウンロード」からはCDD Vaultのカタログをダウンロードできます。

孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能 MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。 拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。 分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。 以下のような分子構築に対応しています。 ■低分子 ■ペプチド・タンパク質 ■アミノ酸配列 ■変異体構築 ■DNA ■糖鎖 ■合成ポリマー ■溶媒分子やカウンターイオンの配置 ■バルクモデル（液滴、周期境界条件） ■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応 以下のような分子シミュレーションが可能です。 ■構造最適化計算 ■配座解析 ■分子動力学計算 ■量子化学計算 ■スペクトル予測(NMR, VCD) ■分子アラインメント ■3D-RISM法による溶媒解析 ■ドッキングシミュレーション

logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います！ 『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

健康増進のための必須ツール 『ジェノプラン』は、ご自身で唾液を採取することで、 簡単に遺伝子検査を行える遺伝子検査キットです。 業界最速クラスの10営業日で検査結果の閲覧が可能。 生活習慣改善に対する食生活・運動習慣・スキンケアなどを最適化できます。 ご要望の際はお気軽に、お問い合わせください。 【遺伝子検査手順】 1.唾液抽出&ウェブ登録 2.唾液配送 3.DNA抽出&分析 4.結果レポート閲覧 5.自身の遺伝子的特徴・リスクポテンシャルの把握 ※詳しくはPDFをダウンロードしていただくか、お気軽にお問い合わせください。

イオン化され得るグループのpKaを計算！蛋白などに対しても利用できます 当社は、pKa（酸塩基解離定数）等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa：高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies：特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point：等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です！ 溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストにKEGGパスウェイ情報を使って生物学的解釈を追加 『Partek Pathway』は、Partek Genomics Suiteで次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを解析して得られた遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているパスウェイを抽出できます。どのようなパスウェイが遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているかを知ることで実験結果に生物学的解釈を得ることができます。 また、『Partek Pathway』は遺伝子の発現情報から全体が協調して発現変動しているパスウェイや一部の遺伝子だけが発現変動していて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。 【対応する解析メニュー】 ■パスウェイエンリッチメント解析 ■パスウェイANOVA パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。 （注）Partek Inc.はKEGG Authorized Service Providerです。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

低分子化合物から生物製剤まで幅広い創薬モダリティに対応したクラウド型電子実験ノート Scilligence ELNは創薬に関わるさまざまな実験を記録できる電子実験ノートです。メディシナルケミストリー、プロセス化学、バイオアッセイ、毒物学、製剤検討など幅広い分野に対応しています。 ウェブブラウザーから簡単に登録・閲覧でき、プロジェクト単位での情報共有が可能なため、社内外での共同研究の促進に貢献します。

置換可能な母核や置換基を高速に検索するBioSolveIT社製、創薬支援ツール 『ReCore』は、母核構造置換、フラグメント付加、複数フラグメントの 結合などのFBDDによる分子構築を簡単な操作で行う事が可能なツールです。 受容体ポケットや既存リガンドの形状、フォーマコフォアやSMARTSによる 官能基位置の拘束を分子構築に反映することができます。 また、分子設計手法として、母核構造置換、フラグメント付加、 複数フラグメントの結合の 3 つのモードを用意しています。 【特長】 ■マウスを用いて結合またはファーマコフォアを指定するだけでFBDDが可能 ■圧倒的な計算速度 ■20 万件のフラグメントデータベースが付属 ■受容体との相互作用を解析 ■受容体ポケットやリガンドの形状、ファーマコフォアを利用した検索が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

リガンドの結合様式を予測！より精度の高いモデル化と計算の高速化を実現！ 『ASEDock』は、統合計算化学システム「MOE」で利用可能なドッキングプログラムです。 低分子などの様々なリガンド候補化合物とタンパク質とのドッキング構造を 高速かつ高精度に予測。受容体ポケットの形状をモデル化した「ASEモデル」と、化合物配座の適合性を評価することで、効率的なドッキングシミュレーションを行います。 化合物のバーチャルスクリーニングに対応し、リガンドの部分構造重ね合わせや、タンパク質構造の誘導適合など数多くのオプション機能が搭載されています。 【特長】 ■化合物の配座を出力 ■様々な環状化合物に対しても適切な配座解析を行う ■配座の重複を除くことで計算の効率を上げる ■妥当な化合物の配置を効率的に発見 ■受容体ポケット内で化合物を構造最適化 ■Induced-Fit（誘導適合）にも対応 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

ChemOffice/ChemDraw シリーズは、化学者と生物学者の研究活動を支援するサイエンスソフトウェアです。 ChemOffice/ChemDraw シリーズはパワフルな描画機能を備え、複雑な分子を可視化します。生体分子も簡単に表現できます。

配列解析に最適化されたスプレッドシートを提供！バイオポリマーを取り扱うことが出来ます 『SARvision Biologics』は、既存のバイオロジックスソフトウエアの 隙間を埋めるデスクトップアプリケーションです。 バイオポリマーのデータを読み込み整理する為の基盤ツールと配列と活性の 関連を見出す様々なツールを提供。 配列解析に最適化されたスプレッドシートが提供され、非天然アミノ酸や 化学的に修飾された残基を含む、核酸、タンパク、ペプチドといった バイオポリマーを取り扱うことが出来ます。 【特長】 ■ペプチド、抗体、RNAに関する研究をを支援 ■非天然アミノ酸、環化、化学修飾を含むペプチドの取り扱いが可能 ■ヒートマップによる活性の視覚化機能 ■興味のある領域のハイライト ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成！ヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須 パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin：立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin：互変異性体の計算 ■Resonance：共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

ゲノムアセンブル、Phasing、Scaffolding、遺伝子予測やアノテーションを含めたデータセットで、実験を強力に支援！ PacBioが出力するロングリード配列を利用して、Assembleパイプラインを実行することにより、染色体に近づくような高品質なContig配列が得られます。 さらに、Phasing（アレルごとのContigが分離されて出力される）やScaffoldingも実現できるようになっています。 ・最新の技術を使用して、ゲノム配列のassemblyや遺伝子予測、機能注釈を含めたリファレンスデータの作成を行います。 ・生物種により、必ずしも同じ手順で、期待通りの結果をなるとは限らず、データ解析の各段階で評価を行いながら手法を検討して進めます。 ・出力結果を検索参照できるWebシステムも提供します。