事例 | イプロス医薬食品技術

PRピークが重複する複雑な有機化合物の構造解析が可能です。

NMRを用いた有機化合物の構造解析では、一般的に1次元NMR (1H-NMR・13C-NMR)のほかに1次元NMR のピーク同士の相関を確認できる2次元NMRを用いてピークを帰属することで化合物の構造を決定します。しかし、類似構造を多数含む糖類などの化合物では2次元NMRでもピークが重複するため解析が困難です。このような場合には3次元NMRが有効です。本資料ではオリゴ糖をモデル化合物として、3...

メーカー・取り扱い企業：一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

【乾燥テスト対応！】オーダーメイドの乾燥機

PRしらす加工場の６０%に納品実績あり！オーダーメイド乾燥機

当社は、しらす工場の約6割に納品実績があり、多種多様な乾燥機を製造しております。製茶加工における熱風乾燥の機器・装置をはじめとして、水産加工・食品加工のプラントなど、幅広い業種で熱風乾燥機の技術を生かした製品を創り出しています。例えば、食品加工の分野は、お客様の製造する食品ジャンルは様々。インスタント食品の野菜や薬味、穀物などの乾燥機や、練り製品の加熱冷却装置など、いずれも製品はオーダ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社河村バーナー製作所

【次世代シーケンス解析事例】MLST解析　※解析事例集進呈中

環境DNAに混在した株を同定することができた解析事例をご紹介します！

MLST(Multi locus sequencing typing)解析とは、複数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した試料(単離株のゲノムに環境DNAに混合したもの)を用意し、タイピングを実施。用意した株はグラム陽性菌、グラム陰性菌で、これらのサ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【使用事例】ゲノム編集ツール『GenomeCraft』

ダブルノックアウトや、遺伝子ノックイン(マウス)などの使用事例をご紹介…

ゲノム編集ツール『GenomeCraft』の使用事例をご紹介します。 “ダブルノックアウト(ゼブラフィッシュ)”への使用では、Cas9蛋白質と 2つの遺伝子に対するsgRNA又はGENOME CRAFT Type CTを混合し、ゼブラフィ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】細菌叢の解析　※解析事例集進呈中

通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事…

直接塩基配列を決定し、通常10,000程度はデータが得られます。さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかったマイナーなグループのデータを得ることができます。【事例概要】 ■PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定 ■得られる塩基配列のデータは通常10,000を超える ■マイナーなグループのデータが得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】12Sアンプリコン解析

検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…

toFishに供与してホモロジー検索を行いました。その結果、検出される魚種数が増加していることが伺え、検出される魚種数を増やすためにPCR反復が有効であることが示唆されました。【事例概要】 ■ラボにてフィルトレーション、DNAを抽出 ■抽出したDNAを用いて、NGSライブラリ調製を行った ■ライブラリ調製は8反復実施 ■調整したライブラリはillumina社のMiseq...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【解析事例】動物培養細胞、植物細胞の挿入部位の決定

RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】微生物ゲノムドラフト解析

取得した生リードをクオリティフィルタリング！ドラフトゲノム配列から遺伝…

ンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。【事例概要】 ■生リード：7.3M paired-endリード(2x300bp) ■アノテーションデータ・遺伝子数：2,417 ・rRNA：6 ・tRNA：49 ※詳しくはPDF資料をご...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】生菌微生物群集構造解析

EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…

選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析(自社データ)をご紹介します。大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって熱処理したサンプルでは大腸...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【解析事例】HTLV-1クロナリティ解析

高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。現在、成人T細胞白血病の診断にはサザン...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック

【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出

ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します！

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの検出を試みました。 ...

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【次世代シーケンス解析事例】ジェノタイピング解析

次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行…

細胞のゲノム編集実験では1度の実験で多様な変異を持つ細胞集団が得られ、実験条件によって変異の様子が異なります。次世代シーケンスなら細胞集団の変異を詳細に評価することが出来ます。【事例概要】 ■CrispRvariantを用いた培養細胞のジェノタイピング ■CRISPR/Casでゲノム編集した培養細胞株からDNA抽出後、　ターゲットアンプリコンシーケンスをMiseqにて実...

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【事例】アンプリコンサンプル調製時におけるPNAの利用について

より解像度の高い餌生物の推定を行うことが可能！次世代シーケンス解析事例…

当社では、植物の葉に存在する微生物の群集構造解析を目的としたアンプリコンサンプルを調製する際に、植物のミトコンドリアおよび葉緑体由来の増幅を抑制させる目的にPNAの添加を行い、良好な結果を得ております。 PNAの添加を行わないと取得データの90％程度がホスト由来の増幅産物のデータとなってしまいます。 PNA添加を行うことによって最大で10％程度に抑えることができ、よ...

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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。外来DNAの挿入位置の決定…

の挿入位置の同定ができます。【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能 ■独自技術により再現性の高い結果が得られる【解析事例】 ◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析少ないDNA量で素早く検出できるRAISING法の特長を活かし、プロウイルス量0.032％でも高い検出感度を実現しています。 ...

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次世代シーケンス解析『ターゲットアンプリコン解析』

オプションサービスを多数ご用意！「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」と…

『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによってリーズナブルにご利用できるサービスです。解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HCO2198）／MiFish（12S V5）など。解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを無償提供し、サンプルをお送りいただきます。その...

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次世代シーケンス解析『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』

サンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archae…

『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』は、パッケージ化することによってリーズナブルにご利用できるサービスです。受け入れサンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）が可能。オプションサービスとして、Prokkaを用いたオートアノテーション、コンティグのBLAST解析、Sequence Typeのタイピングをご用意しております。ご用命の際は...

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【次世代シーケンス解析事例】野生生物の食性解析

COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※…

具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコードオブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を行います。【事例概要】 ■MiSeqを用いた解析では腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析 ■具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、　COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施 ※詳し...

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【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析

外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であ…

び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。ブロッキングプライマーを用いた解析手法が、外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で有効な手段であることを見出しました。【事例概要】 ■ブロッキングプライマー存在下/非存在下でPCRを実施 ■ハマキホソガ幼虫274検体についてCOIアンプリコン解析をMiseqにて実施 ■得られたリードから、ハマキホソガ10種と寄生蜂...

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【次世代シーケンス解析事例】16SrRNAアンプリコン解析

微生物群集構造解析の結果や、主座標分析、レアファクションカーブなどをご…

土壌サンプルの自社データをご紹介します。当データは、4地点について各4サンプル解析した結果です。 MiSeqでの取得データについては各サンプルおよそ10万リード程度得られています。納品データはhtml形式のファイルが含まれており、グラフ等は webブラウザでの閲覧が可能なので、ぜひ関連リンクよりご覧ください。【概要】 ■16SrRNAのV4領域のデータを用いた...

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