薬物代謝に関わる遺伝子多型解析

PRマスアレイ法により複数の遺伝子多型を同時に解析できます

薬物の代謝活性には個人差があり、この違いは遺伝子多型に起因するとされています。ゲノム薬理学（PGx：Pharmacogenomics）分野では、遺伝子多型を調べることで、医薬品の効果や副作用、薬の組み合わせの影響などを考慮したオーダーメイド医療への応用が期待されています。 本資料では、マスアレイ法によるデザイン済み解析ツールを用いた薬物代謝に関わる遺伝子多型解析について紹介します。20の薬物代謝...

メーカー・取り扱い企業： 一般財団法人材料科学技術振興財団　MST

『ポリリジン』 | 天然微生物が発酵する天然カチオンポリマー

PR食品保存料・衛生材料・日用品に使用できるアミノ酸由来の天然カチオンポリ…

ε-ポリリジン（以下、ポリリジン）はヒト必須アミノ酸のL-リジンのε位のアミノ基とα位のカルボキシル基がアミド結合により25～35個連なったホモポリマーです。 30年以上の製造実績があり、食品保存料として広く使用されているアミノ酸由来の保存料ですので、衛生材料などでも活用できます。 例えば、ウェットティッシュ、歯磨き粉、シャンプー、スカルプケアなど生活に密着した日用品の、合成ポリマー削...

メーカー・取り扱い企業： JNC株式会社

【使用事例】ゲノム編集ツール『GenomeCraft』

ダブルノックアウトや、遺伝子ノックイン(マウス)などの使用事例をご紹介…

ゲノム編集ツール『GenomeCraft』の使用事例をご紹介します。 “ダブルノックアウト(ゼブラフィッシュ)”への使用では、Cas9蛋白質と 2つの遺伝子に対するsgRNA又はGENOME CRAFT Type CTを混合し、 ゼブラフィッシュ胚にインジェクションして、発生の様子を観察。 受精1日後にGFPで染色された心臓の形成異常が、2日...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック

ゲノム編集ツール『GenomeCraft‐ドナーDNA』

ssODN合成、ssDNA作製、ターゲティングベクター作製をご紹介しま…

列をノックインするドナーDNAとしてご利用可能。 「ssDNA(一本鎖DNA)作製」では、オリゴDNA合成では対応できない長鎖の 一本鎖DNAを作製し、「ターゲティングベクター作製」では、遺伝子ノックアウトや ノックイン等、遺伝子ターゲティング用のドナーDNAを作製いたします。 ご用命の際は、お気軽にお問い合わせください。 【サービス内容】 ■ssODN(一本鎖オリゴドナ...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック

『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定…

来DNAの挿入位置を検出する方法です。 少ないDNA量で再現性の高い測定結果がスピーディーに得られます。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、 創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、 ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、 外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。 【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】微生物ゲノムドラフト解析

取得した生リードをクオリティフィルタリング！ドラフトゲノム配列から遺伝…

MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。 取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、 さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。 【事例概要】 ■生リード：7.3M paired-endリード(2x300bp) ■アノテーションデータ ・遺伝子数：2,417 ・rRNA：6 ・tRNA：49...

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【次世代シーケンス解析事例】MLST解析　※解析事例集進呈中

環境DNAに混在した株を同定することができた解析事例をご紹介します！

MLST(Multi locus sequencing typing)解析とは、複数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。 当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した 試料(単離株のゲノムに環境DNAに混...

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DNAランダムインテグレーション解析

短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析

Aが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランスジーン...

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【次世代シーケンス解析事例】生菌微生物群集構造解析

EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…

。 大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと 処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに 対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。 その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって 熱処理したサンプルでは大腸菌はほとんど検出されませんでした。 この他、関連リンクでは、RN...

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【次世代シーケンス解析事例】ジェノタイピング解析

次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行…

ゲノム編集技術は自由な遺伝子改変を可能にするパワフルなツールですが、 改変個体を選抜する上で、遺伝型解析(ジェノタイピング)は重要な工程です。 次世代シーケンスにより、F0世代でのアリル頻度を評価することで、 交配...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック

【次世代シーケンス解析事例】野生生物の食性解析

COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※…

腸内細菌叢の 解析と同様にPCR産物を直接解析。 具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコード オブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を行います。 【事例概要】 ■MiSeqを用いた解析では腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析 ■具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、 　CO...

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【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析

外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であ…

同士での共存に関わるプロセスを研究されております。 当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。 本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことで ホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストである ハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。 ブロッキングプライマーを用いた解析手法が、外見から検出が困難な ホストと寄生...

メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック