解析 | イプロス医薬食品技術

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『次世代シーケンサ　受託解析サービス』研究支援サービス

PRシーケンシングから候補遺伝子の絞り込みまで、研究支援のための一貫したソ…

当社は、シーケンシング、候補遺伝子の絞り込み、データ評価のプロセスをカバーする『次世代型シーケンサ受託解析サービス』を行っています。豊富な知見をもとに、研究テーマに合わせた解析方法の選定をはじめ、解析後のデータ評価も含め、専門スタッフがサポート。一貫したサービスにより、お客様の研究成果に繋がるソリューションを提供可能です。【特長】 ■次世代型シーケンサによる受託解析方...

メーカー・取り扱い企業：株式会社メイズ
【資料】超高速フローサイトメーターを最大限に活用するヒントとコツ

PRハイスループット処理とマルチプレックス解析を実現！超高速フローサイトメ…

当資料では、超高速のフローサイトメトリープラットフォームを最大限に活用するヒントとコツについて解説しております。細胞ベースの分析では、細胞単位ベースでの情報を提供する機器としてフローサイトメーターが依然として有力なツールです。しかし従来のフローサイトメーターは、ハイスループットなデータ獲得が要求される最新の創薬研究に適した設計ではなく、そのまま研究ワークフローに当てはめようとすると、ワーク...

メーカー・取り扱い企業：ザルトリウス・ジャパン株式会社
次世代シーケンス解析『ターゲットアンプリコン解析』

オプションサービスを多数ご用意！「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」と…

『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによってリーズナブルにご利用できるサービスです。解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HC...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
次世代シーケンス解析『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』

サンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archae…

『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』は、パッケージ化することによってリーズナブルにご利用できるサービスです。受け入れサンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）が可能。オプ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】MLST解析　※解析事例集進呈中

環境DNAに混在した株を同定することができた解析事例をご紹介します！

MLST(Multi locus sequencing typing)解析とは、複数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した試料(単離株のゲノム...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
DNAランダムインテグレーション解析

短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析

外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランスジーン挿入位置決定法に比べて、短時間、簡便、高感度、低コストでの解析を実現します。...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】細菌叢の解析　※解析事例集進呈中

通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事…

当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “細菌叢の解析”の例では、PCR産物を解析対象として直接塩基配列を決定し、通常10,000程度はデータが得られます。さらに、クローンライブラリー法では得ることが非常に難しかったマイナーなグループの...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】生菌微生物群集構造解析

EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…

選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析(自社データ)をご紹介します。大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに対してDNA抽...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【解析事例】HTLV-1クロナリティ解析

高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。現在、成人T細胞白血...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』

国立感染症研究所との共同研究により開発。外来DNAの挿入位置の決定…

薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定ができます。【特長】 ■目的・ターゲットにあわせて解析のアレンジが可能 ■一度の解析で複数の挿入部位を検出可能 ■独自技術により再現性の高い結果が得られる【解析事例】 ◎HTLV-1（ヒトT細胞白血病ウイルス）クロナリティ解析少ないD...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】微生物ゲノムドラフト解析

取得した生リードをクオリティフィルタリング！ドラフトゲノム配列から遺伝…

海洋研究開発機構深海・地殻内生物圏研究分野の先生より、新規海洋性プロテオバクテリアを提供いただき、解析した結果をご紹介します。次世代シーケンサー(MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。取得した生リードをクオリティフィルタリングした...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】ジェノタイピング解析

次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行…

ゲノム編集技術は自由な遺伝子改変を可能にするパワフルなツールですが、改変個体を選抜する上で、遺伝型解析(ジェノタイピング)は重要な工程です。次世代シーケンスにより、F0世代でのアリル頻度を評価することで、交配に用いるべき個体選抜を行うことが可能。また、培養細胞のゲノム編集実験では...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】12Sアンプリコン解析

検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…

魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて解析した例をご紹介いたします。相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバン消毒液を1ml/L添加。常温で持ち帰り、ラボにてフィ...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【解析事例】動物培養細胞、植物細胞の挿入部位の決定

RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。アグロバクテリウム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出

ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します！

当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの事例をご紹介します。 CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの検出を...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【事例】アンプリコンサンプル調製時におけるPNAの利用について

より解像度の高い餌生物の推定を行うことが可能！次世代シーケンス解析事例…

当社では、植物の葉に存在する微生物の群集構造解析を目的としたアンプリコンサンプルを調製する際に、植物のミトコンドリアおよび葉緑体由来の増幅を抑制させる目的にPNAの添加を行い、良好な結果を得ております。 PNAの添加を行わないと...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】野生生物の食性解析

COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※…

当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の解析と同様にPCR産物を直接解析。具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコードオブライフ・イニシャチブで動物のバーコー...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】COI アンプリコン解析

外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であ…

京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことでホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストであるハマキホソガの同定及び...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック
【次世代シーケンス解析事例】16SrRNAアンプリコン解析

微生物群集構造解析の結果や、主座標分析、レアファクションカーブなどをご…

土壌サンプルの自社データをご紹介します。当データは、4地点について各4サンプル解析した結果です。 MiSeqでの取得データについては各サンプルおよそ10万リード程度得られています。納品データはhtml形式のファイルが含まれており、グラフ等は webブラウザでの...

メーカー・取り扱い企業：株式会社ファスマック