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1runより依頼可能！迅速な結果報告ができるレンタル解析サービス
『受託シーケンス解析 レンタル解析サービス』は、 「共通機器が混み合っている際に、泳動のみ依頼したい」 「特殊な条件でのシーケンス反応を行っている」 「シーケンス反応産物の泳動をより安く、早く行いたい」 ...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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オプション作業を承ることも可能！組み換え抗体の作製をサポートいたします
ファスマックでは、『抗体配列シーケンス解析』を承っております。 抗体可変配列の取得により、組み換え抗体の作製をサポート。 ハイブリドーマに発現するマウスIgG遺伝子 可変配列を5’RACE法、 またはRT-PCRにより増...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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次世代シーケンス解析の基礎知識・メリットを解説！具体的な解析事例も多数…
これから次世代シーケンス解析を検討されたい方に向けて、 具体的な解析事例を多数紹介した資料をダウンロードいただけます。 また実際の解析データや関連サービスを本資料内のリンクから閲覧する事も出来、 よりイメージしてい...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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オプションサービスを多数ご用意！「菌群組成グラフ」や「ヒートマップ」と…
『ターゲットアンプリコン解析』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 解析対象領域は、16S V4／18S V9／ITS（gITS7-ITS4）／COI （mlCOIintF-HCO2198）／MiFish（12S V5）など。 解析対象領域を増幅ターゲットとしたサンプル調製用プライマーを 無償提供し、サンプルをお送りいただきます。 その...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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アンプリコン解析やゲノムドラフト解析など！次世代シーケンス解析について…
ファスマックでは、『次世代シーケンス解析』を承っております。 サンガー法によるDNA解析は広く普及している技術であり、現在は 「遺伝子診断」といったかたちで一般の人にも少しずつ認知されつつあります。 当社は、イルミナ社...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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サンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archae…
『微生物ゲノムドラフト解析パッケージ』は、パッケージ化することによって リーズナブルにご利用できるサービスです。 受け入れサンプルは、バクテリア（Bacteria）およびアーキア（Archaea）が可能。 オプションサービスとして、Prokkaを用いたオートアノテーション、 コンティグのBLAST解析、Sequence Typeのタイピングをご用意しております。 ご用命の際は...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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【次世代シーケンス解析事例】細菌叢の解析 ※解析事例集進呈中
通常10,000程度のデータと、マイナーなグループのデータが得られる事…
【その他の事例概要】 ■サンプル調製はPCR産物の精製までで、クローニングは不要 ■得られた一つ一つのデータは解析対象であるPCR産物に含まれる1分子に由来 ■クローニング→サンガー法のシーケンス解析で得られた一つ一つのデータに相当 ■クローンライブラリー法とは比較にならないデータ量が得られる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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次世代シーケンスを利用することで、より高い解像度でジェノタイピングを行…
ゲノム編集技術は自由な遺伝子改変を可能にするパワフルなツールですが、 改変個体を選抜する上で、遺伝型解析(ジェノタイピング)は重要な工程です。 次世代シーケンスにより、F0世代でのアリル頻度を評価することで、 交配に用いるべき個体選抜を行うことが可能。 また、培養細胞のゲノム編集実験では1度の実験で多様な変異を持つ 細胞集団が得られ、実験条件によって変異の様子が異なります。 ...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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『RAISING法によるランダムインテグレーション解析サービス』
国立感染症研究所との共同研究により開発。 外来DNAの挿入位置の決定…
やウイルスベクターによる ノックインのオフターゲット検出、など… ・納品物：品質値付きのMiseq出力配列（fastqファイル） 【その他 応用技術のご紹介】 「抗体配列シーケンス解析」 抗体可変配列の取得により、組み換え抗体の作製をサポートいたします。 ハイブリドーマに発現するマウスIgG遺伝子 可変配列を5’RACE法、 またはRT-PCRにより増幅、大腸菌でDN...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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更なる納期短縮を実現！専門のスタッフが全てのデータを目視で確認していま…
当社の『DNAシーケンスサービス』は、国内での解析のため、きめ細やかで 迅速な対応が可能です。 今までもスピード感を重視したサービスをご提供しておりましたが、 この度更なる納期短縮を実現。 これまで同様の高品質なデータと短納期により、お客様の研究をさらに 加速させます。このスピード感を一度お試しください。 【特長】 ■国内での解析のため、きめ細やかで迅速な対応が可能 ■...
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検出される魚種数を増やすために、PCR反復が有効であることが示唆された…
魚類のDNAメタバーコーディングに使用されるMiFishを用いて 解析した例をご紹介いたします。 相模川水系の複数地点にて採水を行い、ポリタンクにプールし、 DNAの劣化を防ぐため、採水直後にオスバン消毒液を1ml/L添加。 常温で持ち帰り、ラボにてフィルトレーション、DNA抽出などを行い、 得られたデータをMitoFishに供与してホモロジー検索を行いました。 その結果、...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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【次世代シーケンス解析事例】MLST解析 ※解析事例集進呈中
環境DNAに混在した株を同定することができた解析事例をご紹介します！
MLST(Multi locus sequencing typing)解析とは、複数の遺伝子領域 (通常7領域以上)の変異をパターン化して、菌のタイピングを行う方法です。 当解析事例(自社データ)は、単離株のゲノムと環境中の菌同定を想定した 試料(単離株のゲノムに環境DNAに混合したもの)を用意し、タイピングを実施。 用意した株はグラム陽性菌、グラム陰性菌で、これらのサンプルについ...
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DNB-SEQによる次世代シーケンス解析 ※解析事例集進呈中
DNB-SEQの導入により大規模なシーケンシングが可能となり、真核生物…
【特徴】 ■1ランあたり最大640Gのシーケンスデータのアウトプットを実現 ■イルミナ社のシーケンサーと変わらないデータクオリティ ■安価、データ増量、多検体解析を実現 イルミナ社製Next-seqとDNB-SEQの比較(RNA-seq)の比較データについてwebサイトで公開しております。...専有ラン、共有ランいずれも対応可能。 QC作業やライブラリ調整からも承っております。...
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次世代シーケンス解析を身近なものに！DNA解析受託サービス
等量混合したサンプルを当社へ発送 ■弊社にてサンプルのQC作業実施後、MiSeqでrun ■データ解析 〈微生物ゲノムドラフト解析〉 ■ゲノムDNA抽出 ■ライブラリー作製 ■シーケンス解析 ■アセンブル解析 ■オートアノテーション ■カスタムサービス お客様の実験プランに応じて、解析内容をお選びいただくサービス ※詳しくはお問い合わせ、またはカタログをダウンロ...
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EMAを用いた手法は生菌群集を解析することが可能であることを示した事例…
選択的膜透過性色素EMAを用いた群集構造解析(自社データ)をご紹介します。 大腸菌が優占した環境サンプルについて、熱処理して殺菌したサンプルと 処理しないサンプルを調整し、EMA処理を行いました。その後、各サンプルに 対してDNA抽出を行い、16Sr RNA遺伝子アンプリコン解析を実施。 その結果、群集構造解析では優占化した大腸菌が死滅したことによって 熱処理したサンプルでは大腸...
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RAISING法によるランダムインテグレーション解析を行った事例を追加…
ム法により挿入したシロイヌナズナのT-DNA タグライン、およびレトロウイルスベクターを挿入したマウス培養細胞に対してRAISING法を行い、サンガー法による挿入部位配列の確認、ならびに次世代シーケンス解析から得られた解読配列を元にゲノム配列へマッピングを行いました。 結果として、動物培養細胞、ならびに植物細胞への挿入位置決定として本手法が有効である事が確認出来ました。 【RAIS法...
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高感度かつ非常に再現性が高いデータが得られる！HTLV-1クロナリティ…
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 HTLV-1(ヒトT細胞白血病ウイルス)は主にCD4陽性T細胞に感染し、 そのプロウイルスが宿主ゲノムにランダムに挿入します。 現在、成人T細胞白血病の診断にはサザンブロット法(HTLV-1クロナリティ解析)を 用いたHTLV-1感染細胞の白血病化(モノクローナル増殖)の検出が必須とされて...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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取得した生リードをクオリティフィルタリング！ドラフトゲノム配列から遺伝…
海洋研究開発機構 深海・地殻内生物圏研究分野の先生より、 新規海洋性プロテオバクテリアを提供いただき、解析した結果を ご紹介します。 次世代シーケンサー(MiSeq)を使用して、シーケンシング解析を行い、 paired-endリードを取得。 取得した生リードをクオリティフィルタリングした後、アセンブルを行い、 さらにドラフトゲノム配列から遺伝子を予測しました。 【事例概要...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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短時間、簡便、高感度、低コストなDNA挿入位置解析
外来DNAが目的位置も含め、ランダムにホストゲノムへ挿入（ランダムインテグレーション）された位置を決定することが可能です。 ウイルスゲノム挿入部位、ウイルスベクター挿入部位、創薬ターゲットとなりうる融合遺伝子の検索、ゲノム編集におけるオフターゲットノックインなど、外来DNAのホストゲノム上の挿入位置の同定に利用できます。 Tail-PCRやLAM-PCR、サザンブロットなどの従来のトランス...
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遺伝子解析技術を利用し、属、種レベルまで正確に判定！品質管理に是非お役…
性が期待できる解析結果を得られるという利点があります。 当社では、遺伝子解析技術を利用した微生物種の同定検査サービスを開始。 貴社の品質管理に是非お役立て下さい。 【特長】 ■シーケンス解析による高い識別能、再現性 ■高精度データベースによる高い信頼性 ※Applied Biosystems『MicroSeq ID システムデータベース』使用 ■細菌、真菌（カビ、酵母） ...
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【解析事例】ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出
ゲノム編集におけるノックインのオフターゲット検出事例をご紹介します！
当社が行ったRAIS法によるランダムインテグレーション解析サービスの 事例をご紹介します。 CRISPR/Casにより作製したノックインマウスについて、RAIS法および NGSの組み合わせによりノックイン効率およびオフターゲットサイトの 検出を試みました。 ノックインに用いたドナーDNAが目的とした9番染色体(chr9)に加えて、 別の染色体へも挿入されていることが示唆されまし...
メーカー・取り扱い企業： 株式会社ファスマック
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マウスやゼブラフィッシュ等の組織片、培養細胞ペレット等からDNA抽出、…
DNAの抽出や精製、PCR、電気泳動(アガロース、キャピラリー電気泳動)、シーケンス解析(サンガー、NGS)等、目的に合わせた解析をご提案いたします。...
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現在開発されているDNA鑑定法やDNA品種識別法として多数使用されてい…
『フラグメント解析』は、お客様が蛍光プライマーを用いて増幅した PCR産物を送付していただき、シーケンサーによるキャピラリー電気泳動で フラグメント長を判定します。 当社では、DNA品種検査や技術開発にお役立てができるように、 キャピラリーシーケンサーを用いたフラグメント解析を実施。 また、お客様のニーズに応じたご提案ができればと思いますので、 まずはお気軽にお問合せ下さい。 ...
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ライブラリー作製からデータ解析まで！ファスマックのRNA-seq解析を…
ランに応じて解析内容を選んでいただく カスタムサービスを多数ご用意しております。 【解析概要】 ■(お客様)サンプル情報のご提供 ■当社にサンプル送付 ■ライブラリー調製 ■シーケンス解析 ■データ解析 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...
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迅速かつ高精度！7つの遺伝子領域を同時に同定し菌のタイピングを行う方法…
にマッピングすることによって 7つの遺伝子領域を同時に同定し菌のタイピングを行う方法であり、 従来の方法に比べて迅速かつ高精度に行うことができると考えられます。 ファスマック次世代シーケンス解析サービスに微生物タイピング解析を ラインアップしました。 ご用命の際はお気軽にお問い合わせください。 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。...
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お客様への信頼性確保と品質向上のために。スクリーニング検査およびDNA…
生物片、骨・貝殻・卵殻、天然繊維、毛(人毛、獣毛)、炭化物(コゲ)、油類、ガラス、結晶類 ■植物異物DNA検査 ・植物異物同定用プライマーを使用したPCR試験により得られたDNAをシーケンス解析し、植物の種類を同定 ■虫異物DNA検査 ・虫異物同定用プライマーを使用したPCR試験により得られたDNAをシーケンス解析し、虫の種類を同定 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか...
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【事例】アンプリコンサンプル調製時におけるPNAの利用について
より解像度の高い餌生物の推定を行うことが可能！次世代シーケンス解析事例…
当社では、植物の葉に存在する微生物の群集構造解析を目的とした アンプリコンサンプルを調製する際に、植物のミトコンドリアおよび 葉緑体由来の増幅を抑制させる目的にPNAの添加を行い、良好な結果を 得ております。 PNAの添加を行わないと取得データの90％程度がホスト由来の増幅産物の データとなってしまいます。 PNA添加を行うことによって最大で10％程度に抑えることができ、 よ...
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クローニング作業全般に費やすお客様の時間と労力を大幅に削減！専門のスタ…
クターのほか、ご提供いただいた 指定ベクターへのクローニングも対応可能。合成配列は二本鎖DNAの状態で ベクターに導入し、プラスミドの状態でお届けいたします。 PCR・クローニング・シーケンス解析といった煩雑な作業に費やすお客様の 時間と労力を大幅に削減いたします。 【特長】 ■国内配送のため、製品の輸送にも余分なお時間をとらせない ■国内製造による安心のサポート体制 ■...
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COI遺伝子の解析を行い、餌生物の推定を実施した事例をご紹介します！※…
当社が承っている『次世代シーケンス』では、お客様の目的に沿った 各種プランを設けており、ご要望に応じたご提案を心がけております。 “野生生物の食性解析”の例では、MiSeqを用いた解析で腸内細菌叢の 解析と同様にPCR産物を直接解析。 具体的には消化管内容物や糞便をサンプルとして、日本バーコード オブライフ・イニシャチブで動物のバーコーディングに用いられている COI遺伝子の解...
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外見から検出が困難なホストと寄生者の関係を解明する上で、有効な手段であ…
京都大学生態学研究センターでは、カエデ属を利用するハマキホソガの 多様化や種同士での共存に関わるプロセスを研究されております。 当社が一部解析を受注いたしましたのでご紹介します。 本解析ではハマキホソガ特異的なブロッキングプライマーを使うことで ホスト由来の遺伝子の増幅を抑えることを可能とし、ホストである ハマキホソガの同定及び体内の寄生者の網羅的な探索を効率的に実施。 ブ...
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微生物群集構造解析の結果や、主座標分析、レアファクションカーブなどをご…
土壌サンプルの自社データをご紹介します。 当データは、4地点について各4サンプル解析した結果です。 MiSeqでの取得データについては各サンプルおよそ10万リード程度 得られています。 納品データはhtml形式のファイルが含まれており、グラフ等は webブラウザでの閲覧が可能なので、ぜひ関連リンクよりご覧ください。 【概要】 ■16SrRNAのV4領域のデータを用いた...
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